111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3631 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  43.61 
 
 		 1473 aa  985    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  47.16 
 
 		 1497 aa  1220    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  47.33 
 
 		 1496 aa  1230    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  43.6 
 
 		 1473 aa  972    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  48.32 
 
 		 1498 aa  1246    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  48.62 
 
 		 1498 aa  1247    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  100 
 
 		 1495 aa  2981    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  32.93 
 
 		 1395 aa  562  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  32.58 
 
 		 1395 aa  559  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  31.94 
 
 		 1393 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  29.48 
 
 		 1631 aa  492  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1439 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  29.89 
 
 		 1494 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  30.58 
 
 		 1439 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  29.98 
 
 		 1459 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  27.91 
 
 		 1611 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  29.47 
 
 		 1481 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1481 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1508 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1744 aa  314  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1376 aa  312  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  30.34 
 
 		 1634 aa  300  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  26.95 
 
 		 1984 aa  262  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1262 aa  259  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  25.49 
 
 		 1847 aa  229  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  27.83 
 
 		 1593 aa  214  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1608 aa  209  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  28.91 
 
 		 1990 aa  204  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1640 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  27.26 
 
 		 2580 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  31.44 
 
 		 1690 aa  191  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  31.1 
 
 		 1680 aa  190  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1625 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1275 aa  169  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  27.93 
 
 		 1489 aa  157  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  25.49 
 
 		 971 aa  105  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  28.08 
 
 		 574 aa  103  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  28.06 
 
 		 568 aa  101  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  29.13 
 
 		 565 aa  97.1  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  26.18 
 
 		 583 aa  96.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  26.99 
 
 		 545 aa  94.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  28.32 
 
 		 443 aa  94.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  27.46 
 
 		 575 aa  92.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  28.64 
 
 		 547 aa  89.4  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  26.23 
 
 		 615 aa  82.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  25.16 
 
 		 603 aa  82  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  26.69 
 
 		 622 aa  77.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  23.43 
 
 		 755 aa  77.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  23.43 
 
 		 755 aa  77  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  23.43 
 
 		 731 aa  77  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  26.67 
 
 		 788 aa  75.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  27.17 
 
 		 788 aa  75.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  26.23 
 
 		 788 aa  73.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  29.19 
 
 		 776 aa  74.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  24.27 
 
 		 755 aa  73.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.46 
 
 		 1107 aa  68.6  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4855  hypothetical protein  22.45 
 
 		 934 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.79 
 
 		 1041 aa  63.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0373  hypothetical protein  21.6 
 
 		 928 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  36.05 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  32.72 
 
 		 1263 aa  59.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0348  hypothetical protein  21.6 
 
 		 928 aa  58.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 475 aa  58.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  23.78 
 
 		 765 aa  58.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.78 
 
 		 867 aa  56.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  30 
 
 		 1088 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  27.78 
 
 		 432 aa  54.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  29.53 
 
 		 482 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  32.56 
 
 		 434 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  27.51 
 
 		 892 aa  53.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 414 aa  54.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  30.51 
 
 		 467 aa  53.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  30.92 
 
 		 1015 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.38 
 
 		 508 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 		 421 aa  52.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  26.39 
 
 		 291 aa  52.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  31.3 
 
 		 528 aa  52.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  29.46 
 
 		 396 aa  52.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  28.92 
 
 		 416 aa  51.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  29.12 
 
 		 1344 aa  51.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.36 
 
 		 863 aa  51.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  29.57 
 
 		 307 aa  51.2  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1831  hypothetical protein  35.71 
 
 		 509 aa  52  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  32.47 
 
 		 448 aa  51.2  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  34.69 
 
 		 559 aa  51.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  30.19 
 
 		 692 aa  49.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1349  hypothetical protein  30.18 
 
 		 634 aa  48.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  43.33 
 
 		 1281 aa  48.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 		 440 aa  47.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.53 
 
 		 886 aa  48.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  27.82 
 
 		 713 aa  48.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 412 aa  48.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  33.08 
 
 		 413 aa  48.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 		 460 aa  48.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  30.59 
 
 		 450 aa  47.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  30.28 
 
 		 242 aa  47.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  28.65 
 
 		 558 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  28.12 
 
 		 447 aa  47  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  28.68 
 
 		 446 aa  47  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 		 439 aa  47  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>