210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47992 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  100 
 
 
432 aa  889    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  38.86 
 
 
440 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  42.74 
 
 
434 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  37.05 
 
 
444 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  40.39 
 
 
460 aa  243  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  39.14 
 
 
499 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  40.23 
 
 
446 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 
441 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  38.62 
 
 
437 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  38.62 
 
 
437 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  37.53 
 
 
413 aa  236  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  35.2 
 
 
484 aa  235  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  40.33 
 
 
445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  37.46 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  39.67 
 
 
445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  39.39 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  39.44 
 
 
437 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  36.27 
 
 
414 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  37.02 
 
 
412 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 
441 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  38.42 
 
 
471 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  38.28 
 
 
437 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
464 aa  229  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 
469 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  36.88 
 
 
444 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  36.8 
 
 
440 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  34.11 
 
 
490 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  36.34 
 
 
439 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  36.34 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 
414 aa  220  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  35.62 
 
 
447 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  35.46 
 
 
421 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  38.29 
 
 
450 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 
437 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  35.54 
 
 
451 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  35.16 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  35.81 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  35.26 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  35.26 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  35.54 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  37.75 
 
 
439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 
459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  34.99 
 
 
447 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  34.82 
 
 
432 aa  209  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  34.26 
 
 
475 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
453 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  34.15 
 
 
446 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  31.68 
 
 
396 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  30.17 
 
 
416 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  36.08 
 
 
1263 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  30.85 
 
 
482 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.7 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.17 
 
 
1107 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  29.61 
 
 
1015 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  29.05 
 
 
1041 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.72 
 
 
867 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.76 
 
 
863 aa  70.5  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  29.19 
 
 
937 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  29.19 
 
 
937 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  26.03 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  27.74 
 
 
892 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  28.27 
 
 
757 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  27.59 
 
 
508 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  28.35 
 
 
761 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  28.18 
 
 
1481 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  31.96 
 
 
149 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  27.87 
 
 
307 aa  60.8  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.8 
 
 
1744 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.17 
 
 
1024 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  27.62 
 
 
1481 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  30.97 
 
 
2132 aa  57.4  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  25.17 
 
 
204 aa  57.4  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  24.75 
 
 
296 aa  57  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  29.37 
 
 
242 aa  57  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.29 
 
 
472 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.63 
 
 
886 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54126  conserved hypothetical protein  35.42 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216144  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.94 
 
 
1749 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  31.61 
 
 
925 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  29.13 
 
 
791 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  29.94 
 
 
788 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  25.81 
 
 
1508 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  29.94 
 
 
788 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 
493 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  29.84 
 
 
713 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  32.43 
 
 
230 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  29.94 
 
 
788 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.17 
 
 
601 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  22.86 
 
 
305 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
450 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10019  protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11840)  27.11 
 
 
826 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0558368  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  28.67 
 
 
467 aa  51.2  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04490  Ran1-like protein kinase, putative  40 
 
 
429 aa  50.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.19941  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119560  chloroplast thylakoid protein kinase STN7, probable  29.94 
 
 
486 aa  50.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  29.3 
 
 
448 aa  50.1  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  30.71 
 
 
618 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  28.57 
 
 
675 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  32.12 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.66 
 
 
1344 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.76 
 
 
681 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>