99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54126 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_54126  conserved hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  958    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216144  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02720  expressed protein  49.4 
 
 
553 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10572  Leucine Rich Repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02450)  26.2 
 
 
543 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.262816  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  35.71 
 
 
1041 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  28.5 
 
 
886 aa  70.1  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  27.01 
 
 
354 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  32.28 
 
 
1263 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.59 
 
 
863 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  32.22 
 
 
647 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  30 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  28.07 
 
 
892 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.52 
 
 
508 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  28.22 
 
 
412 aa  60.5  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  26.99 
 
 
471 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  28.02 
 
 
1024 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  39.18 
 
 
867 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  29.66 
 
 
1015 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  33.05 
 
 
296 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  36.36 
 
 
484 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.73 
 
 
1107 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  35.42 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  28.03 
 
 
414 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  29.09 
 
 
291 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  28.76 
 
 
438 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  27.39 
 
 
396 aa  53.9  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  29.75 
 
 
293 aa  53.9  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  26.97 
 
 
460 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.62 
 
 
482 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  31.37 
 
 
1749 aa  53.5  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  28.39 
 
 
421 aa  53.5  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 
439 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 
445 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  26.49 
 
 
444 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  25.16 
 
 
440 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  28.65 
 
 
446 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.16 
 
 
476 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  29.69 
 
 
980 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  35.71 
 
 
1744 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  25.49 
 
 
307 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  25.27 
 
 
459 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4538  leucine-rich repeat protein  26.37 
 
 
225 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 
414 aa  51.6  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  26.58 
 
 
436 aa  51.6  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 
469 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  30.77 
 
 
937 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
437 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  30.77 
 
 
937 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
437 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
437 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  34.31 
 
 
675 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  39.6 
 
 
713 aa  50.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44362  predicted protein  34.58 
 
 
1083 aa  50.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 
441 aa  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  35.37 
 
 
802 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31.09 
 
 
242 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 
445 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  25.35 
 
 
439 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  24.84 
 
 
467 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  29.21 
 
 
451 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  26.97 
 
 
434 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  24.34 
 
 
447 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  24.34 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  28.06 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
436 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
450 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  25.83 
 
 
473 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 
464 aa  47.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  23.68 
 
 
448 aa  47.4  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  31.82 
 
 
755 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  31.82 
 
 
755 aa  47.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 
451 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  31.82 
 
 
731 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  30.12 
 
 
757 aa  47  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2365  leucine-rich repeat-containing protein  27.18 
 
 
569 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.505593  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  36.59 
 
 
761 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  31.17 
 
 
451 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  24.14 
 
 
791 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.48 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  31.17 
 
 
446 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
475 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  23.03 
 
 
1344 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 
447 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  32.47 
 
 
1281 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 
447 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  30 
 
 
499 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  40.58 
 
 
149 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 
437 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 
441 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  24.39 
 
 
2324 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  31.25 
 
 
972 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  27.43 
 
 
478 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  34.15 
 
 
1088 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  32.97 
 
 
1481 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  23.45 
 
 
444 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  32.91 
 
 
1481 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  25.9 
 
 
528 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  28.09 
 
 
451 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  25.16 
 
 
440 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>