95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4538 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4538  leucine-rich repeat protein  100 
 
 		 225 aa  465  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  39.22 
 
 		 863 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  44.16 
 
 		 1041 aa  68.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  35.38 
 
 		 892 aa  68.6  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  28.26 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  28.74 
 
 		 1015 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  36.52 
 
 		 713 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.18 
 
 		 1263 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.2 
 
 		 1107 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  31.52 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  35.35 
 
 		 937 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  24.32 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  35.35 
 
 		 937 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  41.89 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  28.12 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  30.71 
 
 		 508 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10647  predicted protein  47.83 
 
 		 75 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642206  normal  0.0385264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  28.28 
 
 		 886 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  27.81 
 
 		 757 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  26.52 
 
 		 1749 aa  53.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  38.75 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1744 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  28.09 
 
 		 1395 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54126  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 		 468 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  28.85 
 
 		 1393 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.31 
 
 		 867 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  32.65 
 
 		 558 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  40 
 
 		 559 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  40 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1395 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  45.45 
 
 		 1344 aa  49.7  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  36.49 
 
 		 467 aa  49.3  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0946  hypothetical protein  37.35 
 
 		 333 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000225711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  27.78 
 
 		 293 aa  49.3  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  25.9 
 
 		 791 aa  48.5  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  34.57 
 
 		 1088 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  32.56 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  28.39 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  32 
 
 		 761 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  25.84 
 
 		 450 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 		 421 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  37.66 
 
 		 972 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  30.48 
 
 		 580 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 		 444 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2065  leucine-rich repeat protein  41.67 
 
 		 108 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  38.24 
 
 		 675 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  37.14 
 
 		 446 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 		 447 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  37.31 
 
 		 744 aa  46.6  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  31.68 
 
 		 528 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  22.91 
 
 		 528 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  34.78 
 
 		 2324 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  29.21 
 
 		 1281 aa  46.2  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  30 
 
 		 569 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  35.14 
 
 		 473 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  32.53 
 
 		 439 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 		 447 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 436 aa  45.1  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  38.57 
 
 		 490 aa  45.1  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  24.2 
 
 		 472 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  39.71 
 
 		 648 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  27.49 
 
 		 656 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  32.05 
 
 		 980 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  36.23 
 
 		 438 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.92 
 
 		 476 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 		 441 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 475 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  39.44 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  33.91 
 
 		 565 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  30.86 
 
 		 396 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 		 414 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  33.78 
 
 		 1024 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  39.44 
 
 		 447 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  31.52 
 
 		 558 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  36.23 
 
 		 539 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 		 436 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 		 453 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  37.88 
 
 		 451 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 464 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  31.91 
 
 		 451 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 		 412 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  37.88 
 
 		 451 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  32.86 
 
 		 484 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  34.33 
 
 		 434 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  37.88 
 
 		 451 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  33.33 
 
 		 247 aa  42  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  32.93 
 
 		 802 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 437 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  37.88 
 
 		 446 aa  42  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62257  predicted protein  39.22 
 
 		 854 aa  42  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.374999  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10572  Leucine Rich Repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02450)  40.62 
 
 		 543 aa  42  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.262816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 		 460 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 437 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 437 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  28.72 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>