296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0461 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  100 
 
 
761 aa  1528    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  30.07 
 
 
863 aa  369  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.41 
 
 
1107 aa  357  5e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  31.73 
 
 
937 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  31.6 
 
 
937 aa  353  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.36 
 
 
867 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  29.54 
 
 
892 aa  319  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.8 
 
 
886 aa  299  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  29.23 
 
 
1015 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  27.93 
 
 
1041 aa  273  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  26.45 
 
 
925 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  22.98 
 
 
811 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  46.53 
 
 
482 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  43.63 
 
 
508 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  43.5 
 
 
416 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  20.7 
 
 
748 aa  128  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  42.56 
 
 
1263 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  41.38 
 
 
354 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  25.64 
 
 
1085 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  35.92 
 
 
296 aa  110  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  38.83 
 
 
307 aa  110  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  33.84 
 
 
713 aa  105  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 
436 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  39.5 
 
 
242 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  34.2 
 
 
1749 aa  102  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  31.64 
 
 
446 aa  101  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  34.11 
 
 
757 aa  99.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  37.91 
 
 
396 aa  98.2  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  31.47 
 
 
1344 aa  97.8  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  31.27 
 
 
451 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  30.55 
 
 
447 aa  97.4  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  30.55 
 
 
447 aa  96.3  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
451 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  42.18 
 
 
291 aa  96.3  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  30.55 
 
 
447 aa  95.1  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  35.98 
 
 
439 aa  95.1  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  36.96 
 
 
414 aa  94.7  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
440 aa  94.4  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  31.27 
 
 
451 aa  94  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  36.23 
 
 
434 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  29.96 
 
 
453 aa  94  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  36.22 
 
 
412 aa  92.8  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  31.71 
 
 
802 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.67 
 
 
472 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  38.25 
 
 
460 aa  91.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.17 
 
 
476 aa  91.3  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
444 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  29.08 
 
 
451 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  35.29 
 
 
413 aa  90.1  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 
473 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  36.26 
 
 
448 aa  89.7  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  39.01 
 
 
445 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0507  hypothetical protein  19.84 
 
 
614 aa  89  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37047  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 
437 aa  88.6  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 
437 aa  88.6  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  35.59 
 
 
459 aa  88.2  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  37.16 
 
 
1024 aa  88.2  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  39.29 
 
 
437 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  37.93 
 
 
648 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  35.05 
 
 
2491 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  33.71 
 
 
439 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  31.44 
 
 
414 aa  87  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.38 
 
 
1266 aa  86.7  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  40.99 
 
 
445 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  38.99 
 
 
440 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  32.31 
 
 
467 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  30.8 
 
 
490 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  37.84 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  35.98 
 
 
441 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 
475 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  36.87 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  35.87 
 
 
464 aa  85.9  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 
437 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
421 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  33.83 
 
 
446 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  41.07 
 
 
438 aa  84  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
469 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  29.65 
 
 
204 aa  82.8  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  31.87 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  38.66 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  33.65 
 
 
972 aa  82  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  40 
 
 
1395 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 
441 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  33.67 
 
 
484 aa  79.7  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  37.57 
 
 
1744 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  39.35 
 
 
1393 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  34.9 
 
 
432 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  30.37 
 
 
528 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2354  leucine-rich repeat protein  30 
 
 
286 aa  76.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6201199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  32.37 
 
 
569 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.32 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  31.4 
 
 
755 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  31.4 
 
 
755 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  31.4 
 
 
731 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  30.08 
 
 
565 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  39.18 
 
 
776 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  32.57 
 
 
760 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  30.51 
 
 
766 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  28.28 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>