28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0508 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  100 
 
 		 811 aa  1670    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  36.45 
 
 		 863 aa  364  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0507  hypothetical protein  30.71 
 
 		 614 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37047  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.94 
 
 		 1107 aa  273  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  29.1 
 
 		 892 aa  267  8e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  30.23 
 
 		 937 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  30.23 
 
 		 937 aa  248  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.42 
 
 		 886 aa  242  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  30.24 
 
 		 867 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  27.59 
 
 		 1015 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  29.37 
 
 		 925 aa  210  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  28.32 
 
 		 1041 aa  197  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  27.5 
 
 		 748 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  23.19 
 
 		 761 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1085 aa  107  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  28.64 
 
 		 998 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  30.17 
 
 		 2198 aa  58.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  27.53 
 
 		 230 aa  52  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  27.17 
 
 		 1266 aa  51.2  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  25.31 
 
 		 193 aa  48.5  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  28.57 
 
 		 220 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  25.29 
 
 		 214 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  23.84 
 
 		 207 aa  45.8  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  24.8 
 
 		 252 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8659  predicted protein  27.33 
 
 		 184 aa  45.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  29.51 
 
 		 215 aa  45.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  32.52 
 
 		 214 aa  44.7  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  28.78 
 
 		 203 aa  44.3  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>