103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH01660 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  84.74 
 
 
314 aa  344  5e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  78.19 
 
 
199 aa  319  1.9999999999999998e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  28.75 
 
 
208 aa  88.2  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  28.92 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  28.75 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  31.76 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  28.66 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  30.51 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  29.76 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  29.94 
 
 
215 aa  82  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  27.11 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  25.47 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  24.38 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  26.9 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  26.82 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  22.67 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  28.66 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  25.41 
 
 
203 aa  79  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  31.93 
 
 
258 aa  78.2  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  29.01 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  26.09 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  25.15 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  29.52 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  33.04 
 
 
171 aa  77  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  26.63 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  26.86 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  27.33 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  24.73 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  29.93 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  24.84 
 
 
236 aa  74.7  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  31.9 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  27.06 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  29.75 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  28.11 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  28.57 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  25.77 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  29.56 
 
 
230 aa  71.2  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  31.47 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  26.82 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  27.17 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  32.76 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  28.89 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  24.24 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  23.84 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  29.41 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  25 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  25.31 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  30.53 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  26.35 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  24.14 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  30.17 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  27.17 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  29.2 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  30.17 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  33.07 
 
 
307 aa  63.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  29.57 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  28.45 
 
 
220 aa  62.4  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  28.45 
 
 
199 aa  62  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  23.86 
 
 
216 aa  61.6  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  25.86 
 
 
198 aa  61.2  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  32.77 
 
 
224 aa  61.2  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  34.41 
 
 
161 aa  60.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0571  small GTP-binding protein  27.71 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000068839  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  25.66 
 
 
240 aa  60.1  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  27.83 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  25.26 
 
 
229 aa  58.5  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  23.3 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  26.72 
 
 
885 aa  57.8  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  21.12 
 
 
159 aa  57.8  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  23.57 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  28.45 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  27.5 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  27.59 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  25 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  25.86 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378034 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  25 
 
 
192 aa  55.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  27.2 
 
 
233 aa  55.1  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  28.81 
 
 
186 aa  54.7  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  20.59 
 
 
1107 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  27.41 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.48 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  24.35 
 
 
867 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.93 
 
 
863 aa  51.6  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  28.7 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  25.54 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  25.95 
 
 
192 aa  49.3  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  23.73 
 
 
892 aa  48.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  21.19 
 
 
261 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  23.73 
 
 
886 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  21.55 
 
 
937 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  30.95 
 
 
175 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  21.55 
 
 
937 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  29.25 
 
 
226 aa  45.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160342 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  27.91 
 
 
811 aa  45.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  27.71 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  22.64 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  22.64 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  32.1 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9927  predicted protein  24.86 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00528881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>