98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH00140 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  82.9 
 
 
192 aa  330  6e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  80.6 
 
 
199 aa  330  8e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  80.31 
 
 
191 aa  326  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378034 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  67.19 
 
 
199 aa  281  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  67.51 
 
 
199 aa  280  9e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  65.98 
 
 
198 aa  270  7e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  62.43 
 
 
226 aa  224  5.0000000000000005e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160342 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  52.38 
 
 
193 aa  207  8e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  51.05 
 
 
199 aa  204  7e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  52.02 
 
 
198 aa  193  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  46.84 
 
 
216 aa  188  5e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  48.96 
 
 
230 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  50.56 
 
 
280 aa  178  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  46.82 
 
 
341 aa  172  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  43.92 
 
 
199 aa  171  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  44.21 
 
 
191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  40.38 
 
 
228 aa  154  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  43.39 
 
 
186 aa  155  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  42.53 
 
 
224 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04782  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  43.75 
 
 
161 aa  135  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.936481  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02880  Rho small monomeric GTPase, putative  40.12 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30484  predicted protein  30.65 
 
 
200 aa  88.2  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0430346  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  30.18 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  29.75 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  30.59 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  29.76 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  29.63 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  26.79 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  26.79 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  29.79 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  27.38 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  28.89 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  29.2 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01910  conserved hypothetical protein  26.38 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606471  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  29.59 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  28.57 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  28.49 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  31.01 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05832  Ras small monomeric GTPase RasB (AFU_orthologue; AFUA_2G07770)  40.59 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.065815  normal  0.88422 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  30 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  33.56 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03434  RAS small monomeric GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05770)  27.91 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.95299  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  30 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  26.47 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  30.3 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  27.94 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  32.04 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  24.74 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03990  vesicle-mediated transport-related protein, putative  29.44 
 
 
681 aa  69.3  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  27.49 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  28.4 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  30 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  25.81 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  27.85 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  26.59 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  28.73 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  27.21 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  29.34 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  27.38 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  28.81 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  27.45 
 
 
237 aa  64.7  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  26.32 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  29.7 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  26.14 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  25.44 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  30.51 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  25.14 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9927  predicted protein  26.79 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00528881  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  33.02 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  27.21 
 
 
211 aa  61.2  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 
240 aa  60.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  24.68 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29006  predicted protein  24.46 
 
 
280 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.779358 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  27.94 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  27.12 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  24.75 
 
 
229 aa  59.3  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  27.97 
 
 
252 aa  59.3  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  22.92 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  23.3 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  25.73 
 
 
218 aa  58.2  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  37.18 
 
 
216 aa  57.8  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  28.95 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  23.95 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  31.01 
 
 
885 aa  55.8  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  27.74 
 
 
261 aa  55.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  26.67 
 
 
175 aa  54.7  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  28.33 
 
 
175 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  30.77 
 
 
307 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  24.18 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57530  predicted protein  24.26 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  28.21 
 
 
220 aa  52.4  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  25 
 
 
314 aa  52  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  25.86 
 
 
254 aa  52  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  27.5 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03171  Rho-like small GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13340)  22.17 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.618201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  28.15 
 
 
174 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  27.5 
 
 
233 aa  45.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>