113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57530 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57530  predicted protein  100 
 
 
237 aa  484  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  54.69 
 
 
202 aa  216  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  50 
 
 
178 aa  167  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  51.52 
 
 
212 aa  165  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  42.19 
 
 
216 aa  159  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01910  conserved hypothetical protein  39.29 
 
 
224 aa  142  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606471  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  50.41 
 
 
192 aa  132  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05832  Ras small monomeric GTPase RasB (AFU_orthologue; AFUA_2G07770)  41.67 
 
 
225 aa  125  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.065815  normal  0.88422 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  40.37 
 
 
182 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  34.86 
 
 
201 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  36.77 
 
 
187 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  34.44 
 
 
211 aa  103  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  34.15 
 
 
206 aa  101  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  34.97 
 
 
208 aa  98.6  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  33.53 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  35.58 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  34.36 
 
 
205 aa  97.4  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  34.29 
 
 
189 aa  95.9  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  30.25 
 
 
207 aa  96.3  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9927  predicted protein  31.36 
 
 
191 aa  95.9  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00528881  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  33.74 
 
 
205 aa  95.1  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  32.14 
 
 
203 aa  94  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  32.16 
 
 
206 aa  93.6  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  32.93 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
171 aa  91.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03434  RAS small monomeric GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05770)  33.52 
 
 
197 aa  89  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.95299  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29006  predicted protein  27.37 
 
 
280 aa  87  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.779358 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  29.51 
 
 
201 aa  86.3  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  33.33 
 
 
215 aa  85.9  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  32.1 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  32.57 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  26.46 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  29.59 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  31.93 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  34.13 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  28.65 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  30.64 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  32 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  32.34 
 
 
210 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  32.37 
 
 
207 aa  81.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  31.52 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  31.93 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  28.65 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  26.44 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  24.19 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  30.53 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  28.72 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  30.12 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  31.1 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  28.57 
 
 
218 aa  72  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  32.5 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  34.19 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  28.83 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  29.94 
 
 
198 aa  71.6  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  34.17 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  34.62 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  29.41 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  29.76 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  26.32 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  28 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  23.67 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  31.41 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  25.52 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  22.8 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  23.93 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  29.65 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  33.76 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  32.32 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  25.79 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  23.17 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  27.71 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  31.28 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  32.48 
 
 
161 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  34.13 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  30.13 
 
 
213 aa  62.8  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  26.19 
 
 
192 aa  62.4  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  30.65 
 
 
212 aa  62  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  22.84 
 
 
213 aa  62  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  30.08 
 
 
280 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  30.72 
 
 
176 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  24.86 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  27.17 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.05 
 
 
165 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  24.27 
 
 
341 aa  58.9  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  23.84 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  30.33 
 
 
885 aa  56.6  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  24 
 
 
211 aa  57  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  31.71 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  25.42 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  25.16 
 
 
261 aa  55.5  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  27.27 
 
 
199 aa  55.1  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  30.63 
 
 
175 aa  54.7  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  28.74 
 
 
161 aa  54.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04782  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  26.76 
 
 
161 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.936481  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30484  predicted protein  29.44 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0430346  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90151  possible rho-like GTPase involved in secretory vesicle transport  30.06 
 
 
680 aa  52.4  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.907201 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03990  vesicle-mediated transport-related protein, putative  25.84 
 
 
681 aa  50.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  26.89 
 
 
159 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  28.93 
 
 
175 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  27.2 
 
 
230 aa  45.8  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>