70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03990 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF03990  vesicle-mediated transport-related protein, putative  100 
 
 		 681 aa  1406    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04167  Mitochondrial Rho GTPase 1 (EC 3.6.5.-)(GTPase EF-hand protein of mitochondria 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5L3]  42.43 
 
 		 634 aa  455  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90151  possible rho-like GTPase involved in secretory vesicle transport  36.94 
 
 		 680 aa  432  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.907201 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45953  predicted protein  24.52 
 
 		 857 aa  159  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535873  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  29.73 
 
 		 199 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  32.96 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.378034 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  31.55 
 
 		 192 aa  70.5  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  29.44 
 
 		 193 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  30.73 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  28.8 
 
 		 203 aa  65.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  32.32 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  29.95 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  30.12 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  32.12 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  29.38 
 
 		 193 aa  60.1  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  29.94 
 
 		 201 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  26.79 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  26.63 
 
 		 207 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  28.3 
 
 		 184 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  30.82 
 
 		 236 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  27.84 
 
 		 199 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  26.6 
 
 		 199 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  29.09 
 
 		 203 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  28.81 
 
 		 216 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  27.69 
 
 		 199 aa  55.1  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  28.12 
 
 		 212 aa  55.5  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  27.81 
 
 		 206 aa  54.7  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  32.72 
 
 		 214 aa  54.3  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  28.57 
 
 		 224 aa  54.3  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  32.77 
 
 		 220 aa  54.3  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  24.85 
 
 		 207 aa  53.5  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  28.21 
 
 		 218 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  29.01 
 
 		 187 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  29.55 
 
 		 198 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  25.6 
 
 		 186 aa  51.6  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  30 
 
 		 210 aa  51.2  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  31.25 
 
 		 205 aa  51.2  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  30.6 
 
 		 229 aa  51.2  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  26.29 
 
 		 202 aa  50.8  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  28.83 
 
 		 226 aa  50.8  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.160342 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  28.57 
 
 		 211 aa  50.8  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  27.12 
 
 		 341 aa  50.4  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  26.09 
 
 		 215 aa  50.8  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  25.81 
 
 		 201 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  27.85 
 
 		 205 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0848585 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  21.86 
 
 		 205 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  22.78 
 
 		 206 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  29.19 
 
 		 213 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  28.26 
 
 		 192 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  28.4 
 
 		 240 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  27.27 
 
 		 224 aa  50.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  28.68 
 
 		 205 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  27.75 
 
 		 200 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.26784 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03434  RAS small monomeric GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05770)  28.8 
 
 		 197 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.95299  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  27.88 
 
 		 208 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  29.13 
 
 		 214 aa  48.5  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  30.41 
 
 		 230 aa  47.8  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  26 
 
 		 867 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  27.87 
 
 		 213 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  29.75 
 
 		 233 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  25.64 
 
 		 252 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29006  predicted protein  26.38 
 
 		 280 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.779358 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  28.03 
 
 		 171 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  25.89 
 
 		 280 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04782  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  31.58 
 
 		 161 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.936481  normal  0.629565 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  27.91 
 
 		 258 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  25 
 
 		 230 aa  45.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03171  Rho-like small GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13340)  25.15 
 
 		 218 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.618201 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  24.57 
 
 		 191 aa  44.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  27.18 
 
 		 298 aa  44.3  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>