120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52636 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  100 
 
 
230 aa  479  1e-134  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  45.14 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  39.44 
 
 
258 aa  139  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  43.82 
 
 
215 aa  135  5e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  41.3 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  43.26 
 
 
201 aa  126  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  47.06 
 
 
252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  38.64 
 
 
200 aa  121  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  38.73 
 
 
183 aa  118  7e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  37.16 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  40.11 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  34.38 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  45.6 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  37.85 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  41.6 
 
 
307 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  34.3 
 
 
215 aa  105  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  37.71 
 
 
210 aa  105  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  37.99 
 
 
213 aa  104  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  38.3 
 
 
220 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  37.63 
 
 
229 aa  101  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  39.55 
 
 
202 aa  99.4  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  31.38 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  35.88 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  34.27 
 
 
205 aa  98.2  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  30.14 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  33.71 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  31.05 
 
 
203 aa  97.4  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  34.71 
 
 
159 aa  96.7  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  35.29 
 
 
201 aa  96.3  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  31.35 
 
 
214 aa  96.3  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  31.07 
 
 
205 aa  95.5  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  32.57 
 
 
206 aa  95.1  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  36.09 
 
 
211 aa  95.1  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  33.9 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  34.71 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  31.43 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  32.62 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  31.4 
 
 
207 aa  92.8  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  33.15 
 
 
207 aa  92.4  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  34.71 
 
 
210 aa  91.7  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  33.52 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  38.27 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  33.15 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  33.87 
 
 
240 aa  89  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  37.12 
 
 
885 aa  87.8  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  40.32 
 
 
175 aa  88.2  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  32.08 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  31.45 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  28.11 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  31.45 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  35.46 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  28.72 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  29.65 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  32.6 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  30.05 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  28.65 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  32.28 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  28.41 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  34.13 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  24.77 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  35.38 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  28.98 
 
 
199 aa  72  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  28.98 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  29.56 
 
 
193 aa  71.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  35 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  27.68 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  30.06 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160342 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  27.96 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  30.66 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  29.89 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  27.03 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  28.73 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  26.11 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09072  Ras family GTPase (Rab4b), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02540)  30.3 
 
 
358 aa  65.9  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  29.31 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  25.29 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_53175  predicted protein  43.08 
 
 
158 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  30.23 
 
 
161 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  25.77 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  28.48 
 
 
314 aa  62  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  29.01 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.15 
 
 
1107 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  26.26 
 
 
171 aa  61.2  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  28.48 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  25 
 
 
892 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  27.83 
 
 
867 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  24.23 
 
 
191 aa  58.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  29.21 
 
 
167 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  28.98 
 
 
161 aa  56.2  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.48 
 
 
165 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56002  predicted protein  25.58 
 
 
162 aa  54.7  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0254308  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  25.86 
 
 
886 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  30.29 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  24.29 
 
 
761 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  26.16 
 
 
925 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0571  small GTP-binding protein  24.58 
 
 
157 aa  50.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000068839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.12 
 
 
863 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  27.72 
 
 
811 aa  49.3  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40171  predicted protein  22.6 
 
 
364 aa  48.9  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  26.74 
 
 
937 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>