147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89948 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  63.29 
 
 
206 aa  258  6e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  56.31 
 
 
211 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  56.16 
 
 
205 aa  236  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  51.94 
 
 
207 aa  230  9e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  52.76 
 
 
203 aa  211  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  50.98 
 
 
208 aa  207  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  49.75 
 
 
203 aa  206  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  48.57 
 
 
208 aa  206  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  57.14 
 
 
201 aa  203  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  52.46 
 
 
205 aa  203  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  42.45 
 
 
220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  46.55 
 
 
213 aa  169  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  40.49 
 
 
210 aa  168  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  39.41 
 
 
214 aa  167  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  47.62 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  44.1 
 
 
210 aa  165  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  46.63 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  46.51 
 
 
203 aa  157  9e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  38.05 
 
 
229 aa  150  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  39.25 
 
 
240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  43.02 
 
 
236 aa  138  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  44.6 
 
 
205 aa  138  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  39.88 
 
 
184 aa  136  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  34.89 
 
 
233 aa  136  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  40.37 
 
 
201 aa  135  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  35.42 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  40.96 
 
 
205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  35.18 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  36.82 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  36.41 
 
 
213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  40.37 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  35.42 
 
 
200 aa  124  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  33.83 
 
 
218 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  34.8 
 
 
207 aa  121  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  36.5 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  37.65 
 
 
174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  37.13 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  33.01 
 
 
252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  33.14 
 
 
183 aa  109  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  41.46 
 
 
885 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  35.87 
 
 
237 aa  108  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  38.18 
 
 
212 aa  108  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  33.93 
 
 
171 aa  103  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  31 
 
 
258 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  33.93 
 
 
220 aa  101  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  34.44 
 
 
175 aa  101  9e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  36.94 
 
 
182 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  29.61 
 
 
261 aa  98.2  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  34.81 
 
 
213 aa  98.2  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  33.71 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  38.24 
 
 
307 aa  97.1  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  30.72 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  32.11 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  39.32 
 
 
175 aa  93.6  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  32.91 
 
 
214 aa  92.8  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  31.74 
 
 
280 aa  92.4  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  32.91 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09072  Ras family GTPase (Rab4b), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02540)  28.88 
 
 
358 aa  89.4  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  33.55 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  32.57 
 
 
187 aa  89  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  32.28 
 
 
254 aa  88.2  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  31.03 
 
 
216 aa  87  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  32.34 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  30.59 
 
 
189 aa  85.5  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  31.61 
 
 
159 aa  85.5  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  30.77 
 
 
341 aa  84.7  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_53175  predicted protein  30.29 
 
 
158 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  34.59 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  28.89 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  25.47 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  28.78 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  31.65 
 
 
161 aa  81.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01910  conserved hypothetical protein  25.88 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  30.57 
 
 
161 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  28.93 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  31.18 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  29.41 
 
 
198 aa  79  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  30.54 
 
 
216 aa  79  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  27.33 
 
 
314 aa  78.6  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05832  Ras small monomeric GTPase RasB (AFU_orthologue; AFUA_2G07770)  29.82 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.065815  normal  0.88422 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  31.43 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  29.34 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  29.34 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03434  RAS small monomeric GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05770)  27.93 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.95299  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  29.3 
 
 
167 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  29.41 
 
 
191 aa  74.7  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378034 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  31.11 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  25.88 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  30.83 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  29.44 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160342 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57530  predicted protein  30.97 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  28.82 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  26.47 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9927  predicted protein  29.38 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00528881  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  25.28 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  29.41 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  27.75 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  25.95 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.7 
 
 
1107 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>