141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE02560 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  491  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  54.01 
 
 
212 aa  206  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  49.21 
 
 
210 aa  195  6e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  43.98 
 
 
210 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  43.96 
 
 
220 aa  164  8e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  45.73 
 
 
202 aa  164  8e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  42.93 
 
 
214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  47.59 
 
 
208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09072  Ras family GTPase (Rab4b), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02540)  39.77 
 
 
358 aa  161  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  44.32 
 
 
208 aa  158  6e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  44 
 
 
201 aa  158  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  43.68 
 
 
205 aa  158  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  44.31 
 
 
211 aa  154  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  46.06 
 
 
203 aa  153  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  41.62 
 
 
206 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  39.2 
 
 
201 aa  150  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  48.39 
 
 
213 aa  149  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  43.64 
 
 
203 aa  148  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  39.25 
 
 
207 aa  146  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  42.86 
 
 
184 aa  145  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  44.38 
 
 
205 aa  145  5e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  37.37 
 
 
207 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  37.56 
 
 
233 aa  142  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  46.04 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  42.53 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  41.62 
 
 
203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  40.91 
 
 
205 aa  139  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  40.7 
 
 
236 aa  139  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  41.56 
 
 
213 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  35.57 
 
 
258 aa  126  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  35.71 
 
 
218 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  36.84 
 
 
206 aa  118  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  36.31 
 
 
212 aa  118  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  42.26 
 
 
200 aa  118  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  38.85 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  35.18 
 
 
207 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  40 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  33.91 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  32.71 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  42.25 
 
 
175 aa  108  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  33.93 
 
 
214 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  32.76 
 
 
215 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  39.34 
 
 
175 aa  99.4  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  33.33 
 
 
183 aa  96.3  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  38.71 
 
 
885 aa  94  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  35.15 
 
 
174 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  30.11 
 
 
213 aa  89.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  29.17 
 
 
237 aa  89  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  29.01 
 
 
171 aa  89.4  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  30.59 
 
 
230 aa  89.4  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  40.5 
 
 
307 aa  88.6  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  29.38 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  27.86 
 
 
220 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  29.01 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  32.3 
 
 
159 aa  85.5  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  33.75 
 
 
176 aa  85.5  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  28.09 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  29.94 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  34 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  32.26 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05832  Ras small monomeric GTPase RasB (AFU_orthologue; AFUA_2G07770)  31.36 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.065815  normal  0.88422 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  30.9 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  25.63 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_53175  predicted protein  34.56 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9927  predicted protein  33.53 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00528881  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  31.01 
 
 
187 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  29.21 
 
 
199 aa  71.2  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  34.57 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01910  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606471  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  32.67 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  28.65 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  28.42 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.95 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  25.7 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  29.34 
 
 
186 aa  64.7  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  28.74 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  27.22 
 
 
341 aa  62.8  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  26.88 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  29.88 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  26.79 
 
 
193 aa  60.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  28.23 
 
 
892 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  26.92 
 
 
161 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57530  predicted protein  30.26 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  30.07 
 
 
161 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  28.57 
 
 
216 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  25.66 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  25.38 
 
 
199 aa  60.1  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.05 
 
 
1107 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  28.57 
 
 
167 aa  59.3  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  25.82 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160342 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  28.73 
 
 
199 aa  59.3  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29006  predicted protein  26.28 
 
 
280 aa  58.9  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.779358 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  25.18 
 
 
314 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  28.85 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  23.91 
 
 
191 aa  58.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378034 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40171  predicted protein  28.93 
 
 
364 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280697  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  27.88 
 
 
191 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  25.56 
 
 
192 aa  57  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  26.27 
 
 
867 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  23.03 
 
 
925 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>