102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_6635 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  100 
 
 
159 aa  330  6e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  42.86 
 
 
201 aa  123  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  40.25 
 
 
214 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  40.37 
 
 
215 aa  117  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  40.48 
 
 
218 aa  115  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  40.37 
 
 
200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  45.3 
 
 
252 aa  107  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  34.36 
 
 
258 aa  106  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  36.77 
 
 
210 aa  103  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  40.13 
 
 
213 aa  102  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  35.19 
 
 
224 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  34.39 
 
 
205 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  33.12 
 
 
208 aa  99  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  34.19 
 
 
214 aa  98.2  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  34.57 
 
 
210 aa  97.8  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  32.3 
 
 
203 aa  97.1  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  33.55 
 
 
220 aa  96.3  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  34.71 
 
 
230 aa  96.7  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  32.3 
 
 
201 aa  96.3  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  32.7 
 
 
184 aa  95.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  33.77 
 
 
211 aa  95.5  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  31.68 
 
 
205 aa  94.4  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  32.92 
 
 
212 aa  94.4  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  31.68 
 
 
203 aa  94.4  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  30.43 
 
 
208 aa  94  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  36.65 
 
 
212 aa  94  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  31.45 
 
 
205 aa  92.8  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  34.38 
 
 
176 aa  92  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  32.91 
 
 
213 aa  91.7  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  35.25 
 
 
307 aa  89.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  33.33 
 
 
236 aa  89.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  31.17 
 
 
206 aa  88.6  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  35.71 
 
 
183 aa  87.8  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  38.46 
 
 
885 aa  87.4  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  32.35 
 
 
215 aa  87.4  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  32.1 
 
 
207 aa  87.8  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  32.3 
 
 
240 aa  85.5  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  31.61 
 
 
207 aa  85.5  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  31.06 
 
 
202 aa  84.7  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  33.33 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  29.48 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  34.78 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  30.46 
 
 
280 aa  82  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  33.33 
 
 
206 aa  82  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  33.33 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  31.45 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  28.57 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  31.21 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  35.22 
 
 
229 aa  77.4  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  35.54 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  27.98 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  29.34 
 
 
207 aa  74.7  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  28.21 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  31.74 
 
 
224 aa  70.9  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  27.75 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  26.75 
 
 
341 aa  68.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  31.85 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  29.32 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  26.19 
 
 
199 aa  63.9  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  27.27 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  27.27 
 
 
198 aa  62.4  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  25.25 
 
 
199 aa  62  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_53175  predicted protein  33.07 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  30.83 
 
 
175 aa  61.6  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.5 
 
 
165 aa  61.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  26.71 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  27.81 
 
 
230 aa  60.8  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  28.21 
 
 
215 aa  60.5  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04782  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  28.93 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.936481  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  21.12 
 
 
193 aa  57.8  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  25.41 
 
 
199 aa  57.4  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  25.77 
 
 
314 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  23.95 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  27.35 
 
 
214 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  28.85 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  23.81 
 
 
192 aa  55.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.83 
 
 
1107 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09072  Ras family GTPase (Rab4b), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02540)  30.4 
 
 
358 aa  54.7  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  25.86 
 
 
220 aa  54.7  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  23.95 
 
 
199 aa  54.7  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  26.42 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  24.79 
 
 
213 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  27.83 
 
 
254 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  25.62 
 
 
199 aa  51.6  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  23.35 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378034 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  28.21 
 
 
202 aa  48.9  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29006  predicted protein  27.56 
 
 
280 aa  47.8  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.779358 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  22.78 
 
 
226 aa  47.4  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160342 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05832  Ras small monomeric GTPase RasB (AFU_orthologue; AFUA_2G07770)  24.24 
 
 
225 aa  46.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.065815  normal  0.88422 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  25.32 
 
 
191 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  22.92 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  22.45 
 
 
192 aa  44.3  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  24.79 
 
 
211 aa  44.3  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88171  predicted protein  26.61 
 
 
296 aa  43.9  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.31194 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  23.38 
 
 
761 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  21.38 
 
 
212 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  24.4 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  20.51 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  22.22 
 
 
216 aa  42  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57530  predicted protein  24.07 
 
 
237 aa  40.8  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>