72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_53175 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_53175  predicted protein  100 
 
 		 158 aa  329  7.000000000000001e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  40.43 
 
 		 201 aa  97.1  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  34.48 
 
 		 200 aa  95.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.26784 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  33.56 
 
 		 218 aa  94.7  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  30.29 
 
 		 207 aa  84.3  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  34.31 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  31.61 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  34.93 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  35.51 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  34.59 
 
 		 224 aa  80.9  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  34.51 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  35.03 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  30.29 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  33.57 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  33.81 
 
 		 236 aa  77.4  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  30.43 
 
 		 214 aa  77.4  0.00000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  34.51 
 
 		 210 aa  77  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  34.85 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  30.94 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  30.12 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  33.55 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  33.8 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  47.83 
 
 		 258 aa  74.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  34.27 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  33.99 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  34.56 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  35.61 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  50.72 
 
 		 215 aa  72  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  33.33 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  31.75 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  33.58 
 
 		 213 aa  70.9  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  29.41 
 
 		 203 aa  70.5  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  53.23 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  32.37 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  31.82 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  47.89 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  44.12 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  31.82 
 
 		 203 aa  67.4  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  43.48 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  26.92 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  31.37 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  50 
 
 		 307 aa  65.5  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  43.08 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  32.19 
 
 		 229 aa  63.5  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  42.5 
 
 		 885 aa  63.9  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  29.14 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  33.07 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  33.85 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  34.19 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09072  Ras family GTPase (Rab4b), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02540)  47.37 
 
 		 358 aa  58.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  31.54 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  29.01 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  46.34 
 
 		 261 aa  50.8  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  28.46 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  27.5 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  27.21 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  29.41 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  24.24 
 
 		 193 aa  47.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  31.01 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  26.21 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  27.73 
 
 		 216 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  27.14 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  26.43 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  27.22 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  29.14 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  33.93 
 
 		 314 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  26.13 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  28.3 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  30.49 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  28.44 
 
 		 254 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  31.03 
 
 		 199 aa  40.8  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  24.03 
 
 		 216 aa  40.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>