110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ02000 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  100 
 
 
175 aa  358  1e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  56.55 
 
 
218 aa  178  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  56.62 
 
 
201 aa  160  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  56.93 
 
 
212 aa  148  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  54.37 
 
 
200 aa  147  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  54.68 
 
 
215 aa  141  5e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  48.78 
 
 
258 aa  138  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  46.93 
 
 
252 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  42.64 
 
 
184 aa  122  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  46.09 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  45.86 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  40.25 
 
 
205 aa  119  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  40.14 
 
 
202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  44.07 
 
 
212 aa  116  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  44.62 
 
 
236 aa  116  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  35.29 
 
 
210 aa  115  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  42.64 
 
 
213 aa  110  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  35.71 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  42.74 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  36.71 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  44.44 
 
 
207 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  39.31 
 
 
213 aa  106  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  41.94 
 
 
210 aa  105  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  39.06 
 
 
220 aa  105  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  34.44 
 
 
207 aa  104  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  39.66 
 
 
203 aa  103  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  32.54 
 
 
224 aa  103  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  38.28 
 
 
208 aa  102  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  38.71 
 
 
214 aa  100  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  35.16 
 
 
201 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  41.33 
 
 
229 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  39.34 
 
 
240 aa  99.4  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  38.16 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  30.38 
 
 
206 aa  99  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  38.52 
 
 
175 aa  99  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  38.94 
 
 
205 aa  94  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  34.38 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  37.5 
 
 
230 aa  89.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  33.59 
 
 
208 aa  89.4  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  46.05 
 
 
885 aa  84  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  35.56 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  33.53 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  32.65 
 
 
233 aa  81.3  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  39.39 
 
 
307 aa  79  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  35.34 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  33.04 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  31.9 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  32.17 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  34.38 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  32.17 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_53175  predicted protein  31.78 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  30.08 
 
 
211 aa  72  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  34.21 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  31.25 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  31.47 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  28.48 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  30.77 
 
 
226 aa  68.2  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160342 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09072  Ras family GTPase (Rab4b), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02540)  25.73 
 
 
358 aa  65.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  32.31 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  32.5 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  34.51 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  27.22 
 
 
216 aa  61.6  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  29.46 
 
 
261 aa  60.8  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  30.34 
 
 
216 aa  60.5  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  31.36 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  30.43 
 
 
254 aa  60.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01910  conserved hypothetical protein  31.08 
 
 
224 aa  59.7  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  35.34 
 
 
161 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  32.59 
 
 
199 aa  57.8  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  29.6 
 
 
193 aa  57.8  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57530  predicted protein  28.7 
 
 
237 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  28.8 
 
 
198 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  32.54 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  27.73 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  29.84 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05832  Ras small monomeric GTPase RasB (AFU_orthologue; AFUA_2G07770)  33.33 
 
 
225 aa  55.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.065815  normal  0.88422 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  29.27 
 
 
191 aa  55.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  27.69 
 
 
193 aa  54.3  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  29.84 
 
 
230 aa  54.3  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  30 
 
 
191 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378034 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  30.33 
 
 
199 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  33.33 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  31.82 
 
 
341 aa  52.4  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  25.37 
 
 
280 aa  52  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  31.65 
 
 
198 aa  51.6  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  26.92 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04782  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  26.98 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.936481  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  28.26 
 
 
199 aa  48.5  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03434  RAS small monomeric GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05770)  30.16 
 
 
197 aa  48.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.95299  normal  0.679233 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  32.41 
 
 
187 aa  47.8  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9927  predicted protein  27.94 
 
 
191 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00528881  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  23.18 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  30.25 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  31.78 
 
 
189 aa  44.7  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  27.71 
 
 
193 aa  44.3  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  26.09 
 
 
314 aa  44.3  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  25.81 
 
 
228 aa  43.9  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  26.51 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  25.4 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01126  ADP-ribosylation factor (Broad)  24.41 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.529772  normal  0.310407 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>