123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68134 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  100 
 
 
220 aa  456  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  62.38 
 
 
210 aa  280  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  60 
 
 
214 aa  274  6e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  65.97 
 
 
205 aa  261  8e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  58.05 
 
 
202 aa  245  4e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  46.67 
 
 
210 aa  191  9e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  45.83 
 
 
212 aa  187  9e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  50.6 
 
 
208 aa  177  9e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  45.28 
 
 
203 aa  177  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  46.82 
 
 
208 aa  176  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  41.47 
 
 
213 aa  175  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  43.81 
 
 
205 aa  174  6e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  41.71 
 
 
206 aa  174  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  42.45 
 
 
207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  43.33 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  50.6 
 
 
203 aa  170  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  47.27 
 
 
211 aa  169  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  45.7 
 
 
201 aa  168  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  43.96 
 
 
240 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  39.55 
 
 
201 aa  162  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  40.55 
 
 
233 aa  159  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  37.91 
 
 
207 aa  159  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  40.67 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  44.32 
 
 
203 aa  145  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  41.21 
 
 
229 aa  145  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  39.51 
 
 
200 aa  139  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  40.1 
 
 
215 aa  136  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  38.22 
 
 
205 aa  132  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  37.97 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  34.48 
 
 
184 aa  129  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  38.19 
 
 
252 aa  128  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  34.93 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  42.07 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  33.96 
 
 
258 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  30.88 
 
 
213 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  34.32 
 
 
206 aa  118  9e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  39.76 
 
 
183 aa  114  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  33.73 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  35.43 
 
 
175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  32.11 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  31.74 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  32.73 
 
 
171 aa  108  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  44.8 
 
 
885 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  31.52 
 
 
237 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  39.33 
 
 
230 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  39.52 
 
 
175 aa  102  5e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  40.28 
 
 
307 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  33.96 
 
 
214 aa  102  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09072  Ras family GTPase (Rab4b), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02540)  28.46 
 
 
358 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  33.55 
 
 
159 aa  96.3  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  36.42 
 
 
174 aa  92  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  32.72 
 
 
176 aa  90.1  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  29.71 
 
 
261 aa  89  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  31.87 
 
 
213 aa  88.2  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  30.43 
 
 
214 aa  87  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  34.38 
 
 
161 aa  85.1  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  29.81 
 
 
215 aa  85.1  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  29.45 
 
 
220 aa  84.7  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  32.3 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  32.78 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01910  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606471  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  32.3 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  32.5 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_53175  predicted protein  33.55 
 
 
158 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  30.43 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  31.61 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  33.95 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  36.36 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  28.91 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  33.33 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  27.59 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  30 
 
 
161 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  30.91 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  34.19 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  33.33 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  29.95 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  33.95 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05832  Ras small monomeric GTPase RasB (AFU_orthologue; AFUA_2G07770)  29.59 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.065815  normal  0.88422 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  25.29 
 
 
314 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  23.84 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  31.58 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  25.6 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  33.61 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  27.78 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  26.71 
 
 
189 aa  63.2  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  28.83 
 
 
167 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  33.06 
 
 
199 aa  63.5  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  31.62 
 
 
341 aa  63.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03434  RAS small monomeric GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05770)  28.49 
 
 
197 aa  62.8  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.95299  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  29.34 
 
 
867 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  26.5 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.92 
 
 
165 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.7 
 
 
1107 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  33.06 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  25.75 
 
 
191 aa  59.3  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378034 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  32.48 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43276  predicted protein  31.25 
 
 
186 aa  58.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.348621 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43397  predicted protein  31.25 
 
 
186 aa  58.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  31.62 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  26.09 
 
 
761 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>