144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_67584 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  63.26 
 
 
205 aa  274  9e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  59.26 
 
 
206 aa  249  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  56.4 
 
 
207 aa  226  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  48.76 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  44.71 
 
 
205 aa  136  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0208811 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  35.68 
 
 
218 aa  126  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  41.18 
 
 
206 aa  125  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  40.7 
 
 
224 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  36.49 
 
 
211 aa  122  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  38.37 
 
 
201 aa  121  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  37.43 
 
 
208 aa  121  9e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.203181 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  37.28 
 
 
210 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  37.06 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  36.5 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  38.82 
 
 
208 aa  119  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  38.38 
 
 
184 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  34.12 
 
 
203 aa  118  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  34.93 
 
 
203 aa  117  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  34.27 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  37.43 
 
 
205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  35.41 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  38.01 
 
 
210 aa  116  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  33.48 
 
 
307 aa  115  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  34.9 
 
 
212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  37.79 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32671  GTP-binding protein  34.6 
 
 
261 aa  114  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  32.11 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  37.35 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  35.67 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  34.32 
 
 
214 aa  111  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  38.1 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  36.31 
 
 
205 aa  108  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  34.97 
 
 
174 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  33.18 
 
 
215 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  32.44 
 
 
258 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  36 
 
 
200 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  36.42 
 
 
201 aa  105  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  34.3 
 
 
230 aa  105  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  37.91 
 
 
205 aa  105  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  32.76 
 
 
240 aa  104  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  36.84 
 
 
212 aa  104  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  40.77 
 
 
885 aa  103  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  39.68 
 
 
252 aa  101  9e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  37.5 
 
 
229 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  31.46 
 
 
183 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  32.18 
 
 
171 aa  98.2  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  31.65 
 
 
233 aa  96.7  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05482  Small GTPase RanA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T4V9]  28.09 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337207  normal  0.914788 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  28.82 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_6635  predicted protein  32.35 
 
 
159 aa  87.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279831  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84260  predicted protein  28.49 
 
 
214 aa  87  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  29.65 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  31.31 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  29.94 
 
 
193 aa  82  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  33.89 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.18 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02285  hypothetical protein  31.55 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  27.93 
 
 
176 aa  79  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02890  RAN small monomeric GTPase, putative  29.44 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  30.26 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  28.11 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  30.73 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  33.53 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09072  Ras family GTPase (Rab4b), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02540)  36.03 
 
 
358 aa  77  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  31.28 
 
 
167 aa  77  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  32.61 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40171  predicted protein  27.98 
 
 
364 aa  75.5  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280697  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  27.69 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  31.71 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  31.46 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  31.32 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  29.69 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  29.7 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  25.68 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_53175  predicted protein  50.72 
 
 
158 aa  72  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  28.81 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  26.67 
 
 
341 aa  71.6  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  28.8 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  30.39 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07206  GTP binding protein (SPG1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10330)  31.75 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.214538  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  26.4 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40841  predicted protein  28.42 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57530  predicted protein  30.49 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01910  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606471  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  24.86 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  28.92 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05832  Ras small monomeric GTPase RasB (AFU_orthologue; AFUA_2G07770)  34.4 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.065815  normal  0.88422 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03434  RAS small monomeric GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05770)  28.11 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.95299  normal  0.679233 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  26.78 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  30.43 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  30.6 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  27.85 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  27.67 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  30.36 
 
 
187 aa  64.7  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  29.48 
 
 
189 aa  64.7  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  29.45 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.378034 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04210  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  27.13 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  26.4 
 
 
226 aa  62.4  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160342 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>