95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9927 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_9927  predicted protein  100 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00528881  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08868  hypothetical protein similar to small GTPase RAS2 (Broad)  44.75 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000107682 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64341  GTP-binding protein of the ras family  45.12 
 
 		 182 aa  154  7e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03660  RHEB small monomeric GTPase, putative  40.12 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.99887  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04685  RAS small monomeric GTPase (Rsr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08950)  37.35 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00182  Ras-like protein Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12526]  34.21 
 
 		 212 aa  97.1  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.326339  normal  0.668577 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44586  predicted protein  31.82 
 
 		 178 aa  92.8  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01910  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 		 224 aa  84.7  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606471  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02810  RAS small monomeric GTPase, putative  32.3 
 
 		 216 aa  84.3  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.191225  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57530  predicted protein  29.75 
 
 		 237 aa  84.3  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51727  predicted protein  32.93 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12689  predicted protein  29.7 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.166155  normal  0.0578353 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15391  predicted protein  28.65 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.591039  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05520  ras-related protein ypt1, putative  28.83 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30139  predicted protein  28.34 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29006  predicted protein  31.25 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.779358 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04281  GTP-binding protein ypt1 (Broad)  28.99 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22713  predicted protein  29.09 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.517638  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05832  Ras small monomeric GTPase RasB (AFU_orthologue; AFUA_2G07770)  32.16 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.065815  normal  0.88422 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71522  GTP-binding protein of the rab family  29.7 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.203181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2203  small GTP-binding protein  28.74 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38767  predicted protein  31.52 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0208811 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06974  Rab GTPase SrgA (Eurofung)  27.62 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000778226 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04340  Rab/GTPase, putative  27.88 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260268  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02560  conserved hypothetical protein  33.53 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00590  conserved hypothetical protein  32.96 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0238603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0881  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.72 
 
 		 165 aa  72  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.334755  hitchhiker  0.000103971 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02630  Rho1 GTPase  31.61 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822258  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35392  GTP-binding protein, rho subfamily  29.44 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0874099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12688  predicted protein  28.92 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0669113  normal  0.123552 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89948  GTP-binding protein  29.38 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.0054767 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  31.33 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40058  predicted protein  28.57 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0532739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51511  predicted protein  32.14 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471468  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01830  RAS1, putative  29.85 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681478  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41392  predicted protein  30.81 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0613331  normal  0.283654 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04140  Rho small monomeric GTPase, putative  29.89 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764266  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51244  GTP-binding protein of the rab/ypt family  29.31 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51810  predicted protein  27.81 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05740  GTP-binding protein rhoA Precursor (Rho1 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9C3Y4]  27.65 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3603  small GTP-binding protein  29.45 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.802563 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22095  predicted protein  28.99 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04953  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  30.22 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00660  RAB small monomeric GTPase, putative  29.59 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04743  RacA (Eurofung)  29.31 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0182808  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44216  predicted protein  29.05 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32150  predicted protein  29.45 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.495831 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63641  Rab5-like GTPase  32.94 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.38675  normal  0.213062 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07487  CD42_CHICK Cell division control protein 42 homolog (G25K GTP-binding protein)MODA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UR50]  28.14 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.358627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35277  Cell division control protein 42 homolog  28.14 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.378034 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00140  Rho small monomeric GTPase, putative  26.79 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03434  RAS small monomeric GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05770)  26.86 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.95299  normal  0.679233 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04960  small GTPase, putative  27.18 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04915  RAB GTPase Vps21/Ypt51, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10740)  31.12 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.222182 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0080  small GTP-binding protein  29.41 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.561103  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21535  predicted protein  29.94 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00089  Small GTPase AvaA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8TGD9]  27.54 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00160  Rho small monomeric GTPase, putative  26.14 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00283225  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61694  predicted protein  31.49 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45361  GTP-binding protein of the rho family  33.83 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.381371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0571  small GTP-binding protein  30.43 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000068839  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24119  predicted protein  29.94 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14983  predicted protein  26.35 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227158  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03625  small GTP-binding protein  28.49 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02687  GTP-binding protein rhoC Precursor (Rho3 protein homolog) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q96WY0]  29.78 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67584  predicted protein  26.26 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0163736 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00347  Ras GTPase similar to RAB11B (Eurofung)  26.67 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.521067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79030  Ras-related small GTPase, Rho type  28.05 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.554484  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03842  RAB GTPase Ypt5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08040)  28.96 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3991  small GTP-binding protein  27.27 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68134  predicted protein  27.44 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00070  Rho GTPase, putative  24.62 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.261976  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68960  GTP-binding protein (RHO4)  28.57 
 
 		 341 aa  54.7  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0983482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  29.52 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33115  predicted protein  30.11 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.26784 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04330  signal transducer, putative  25.27 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00186621  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88308  predicted protein  28.57 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31160  predicted protein  26.22 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_51199  predicted protein  26.63 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82174  RHO small monomeric GTPase signal transduction  25.61 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.160342 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00920  Rab family GTP-binding protein, putative  31.78 
 
 		 885 aa  49.7  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01820  ras-related protein ypt3 (rab), putative  28.7 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01190  GTPase, putative  28.83 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62699  predicted protein  24.57 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.1708  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41856  predicted protein  23.24 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00446099  hitchhiker  0.00310862 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90151  possible rho-like GTPase involved in secretory vesicle transport  33.33 
 
 		 680 aa  45.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.907201 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02000  GTPase, putative  28.03 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52636  GTP-binding protein of the rab family  27.62 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02474  ras-like GTP-binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03100)  28.23 
 
 		 307 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01660  small monomeric GTPase, putative  24.86 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03990  vesicle-mediated transport-related protein, putative  30.43 
 
 		 681 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30484  predicted protein  27.68 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0430346  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00140  GTPase, putative  23.74 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0177882  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04782  hypothetical protein similar to Rho GTPases (Eurofung)  25.9 
 
 		 161 aa  42  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.936481  normal  0.629565 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05106  secretion related GTPase SrgD (AFU_orthologue; AFUA_1G07680)  27.27 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00933055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>