238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6989 on replicon NC_013733
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  100 
 
 		 925 aa  1886    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  37.45 
 
 		 1015 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  38.37 
 
 		 1041 aa  441  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  37.43 
 
 		 892 aa  428  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  36.4 
 
 		 886 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  34.85 
 
 		 937 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  34.58 
 
 		 937 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 863 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.23 
 
 		 1107 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.11 
 
 		 867 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  41.85 
 
 		 748 aa  339  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  26.64 
 
 		 761 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  31.27 
 
 		 811 aa  207  7e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  23.77 
 
 		 1085 aa  167  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.17 
 
 		 1263 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  34.11 
 
 		 713 aa  107  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  22.54 
 
 		 998 aa  104  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  29.11 
 
 		 482 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  28.64 
 
 		 354 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.86 
 
 		 508 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.6 
 
 		 1344 aa  89.4  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  28.57 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  26.78 
 
 		 1266 aa  84.7  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  27.14 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  25 
 
 		 472 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  28.57 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  28.3 
 
 		 757 aa  81.6  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  26.85 
 
 		 580 aa  81.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  26.91 
 
 		 2132 aa  77  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  26.48 
 
 		 1024 aa  77.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  25.81 
 
 		 1749 aa  77.4  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29 
 
 		 476 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  28.87 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  26.84 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  31.92 
 
 		 279 aa  73.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  24.89 
 
 		 414 aa  73.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  28.76 
 
 		 802 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 		 459 aa  72  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  27.6 
 
 		 448 aa  72  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0507  hypothetical protein  22.63 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37047  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  27.06 
 
 		 440 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  31.61 
 
 		 432 aa  70.5  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  24.11 
 
 		 437 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  24.11 
 
 		 437 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  24.11 
 
 		 437 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  26.95 
 
 		 439 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  30.3 
 
 		 791 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  25.65 
 
 		 296 aa  69.7  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  30.74 
 
 		 1088 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  40.16 
 
 		 675 aa  68.9  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  31.11 
 
 		 972 aa  68.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  30.86 
 
 		 204 aa  67  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  33.33 
 
 		 2198 aa  67.4  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  25.68 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  26.9 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  24.4 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1744 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  29.31 
 
 		 648 aa  65.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  25.36 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  24.71 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  23.39 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  24.87 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  35.08 
 
 		 531 aa  64.7  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  20.7 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  30.81 
 
 		 184 aa  63.9  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  23 
 
 		 460 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  27.46 
 
 		 451 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  24.57 
 
 		 441 aa  63.9  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  27.19 
 
 		 396 aa  63.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.62 
 
 		 305 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  30.3 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  35 
 
 		 744 aa  63.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  31.06 
 
 		 446 aa  63.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  24.35 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  24.41 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  26.11 
 
 		 569 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  23.14 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  24.87 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  24.59 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  21.6 
 
 		 559 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  24.27 
 
 		 441 aa  62  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  27.88 
 
 		 484 aa  62  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 		 473 aa  62  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  28.67 
 
 		 149 aa  62  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2354  leucine-rich repeat protein  32.49 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6201199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  29.35 
 
 		 293 aa  62  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  26.35 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  24.41 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 772 aa  61.2  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32675  predicted protein  26.32 
 
 		 205 aa  60.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0848585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  24.24 
 
 		 445 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  23.39 
 
 		 450 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  31.11 
 
 		 490 aa  60.1  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  23 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>