14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0507 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0507  hypothetical protein  100 
 
 		 614 aa  1228    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37047  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  28.77 
 
 		 811 aa  282  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  26.05 
 
 		 863 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.95 
 
 		 1107 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  24.28 
 
 		 937 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  24.28 
 
 		 937 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  24.69 
 
 		 867 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  25.28 
 
 		 886 aa  101  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  24.69 
 
 		 892 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  19.84 
 
 		 761 aa  93.2  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  22.42 
 
 		 1015 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  22.63 
 
 		 925 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  21.3 
 
 		 1041 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  22.08 
 
 		 748 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>