More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3344 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  65.37 
 
 		 886 aa  1142    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  100 
 
 		 892 aa  1788    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  42.9 
 
 		 863 aa  513  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  40.38 
 
 		 1041 aa  477  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.2 
 
 		 1107 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  38.19 
 
 		 1015 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  40.16 
 
 		 867 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  38.51 
 
 		 937 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  37.43 
 
 		 925 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  38.26 
 
 		 937 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  29.54 
 
 		 761 aa  300  9e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  36.57 
 
 		 748 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  29.1 
 
 		 811 aa  261  3e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1085 aa  178  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  46.23 
 
 		 416 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  45.08 
 
 		 482 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  43.81 
 
 		 1263 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  44.13 
 
 		 508 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  40.79 
 
 		 354 aa  154  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  36.46 
 
 		 1749 aa  139  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  36.36 
 
 		 713 aa  130  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.94 
 
 		 476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  42.79 
 
 		 307 aa  123  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  36.17 
 
 		 757 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  37.98 
 
 		 296 aa  122  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  38.1 
 
 		 2491 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  37.05 
 
 		 1024 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  38.22 
 
 		 242 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  40.61 
 
 		 448 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  34.02 
 
 		 472 aa  114  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  29.35 
 
 		 1344 aa  104  7e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  28.33 
 
 		 998 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  33.99 
 
 		 467 aa  102  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  46.43 
 
 		 291 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  27.16 
 
 		 1266 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  34.36 
 
 		 1017 aa  99.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  36.32 
 
 		 437 aa  97.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  36.07 
 
 		 204 aa  95.1  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  36.99 
 
 		 230 aa  94.7  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  40.45 
 
 		 475 aa  94.4  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  43.84 
 
 		 443 aa  93.6  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  33.14 
 
 		 440 aa  91.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  36.11 
 
 		 413 aa  91.3  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  37.5 
 
 		 396 aa  91.7  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  35.39 
 
 		 460 aa  90.5  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  33.03 
 
 		 412 aa  90.9  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  29.71 
 
 		 2132 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  34.12 
 
 		 444 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  33.5 
 
 		 478 aa  90.1  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 		 414 aa  90.1  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 		 439 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  35 
 
 		 776 aa  88.6  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  34.15 
 
 		 648 aa  88.2  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  36.99 
 
 		 421 aa  88.2  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  36.31 
 
 		 447 aa  88.2  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  34.12 
 
 		 473 aa  87.8  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  32.84 
 
 		 559 aa  87.8  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  36.31 
 
 		 453 aa  87.8  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 451 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  36.31 
 
 		 446 aa  87  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  35.2 
 
 		 447 aa  87  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2354  leucine-rich repeat protein  35.54 
 
 		 286 aa  86.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6201199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  34.59 
 
 		 446 aa  87  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  36.31 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  32.52 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  31.69 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  34.83 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0507  hypothetical protein  23.75 
 
 		 614 aa  85.1  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  32.95 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  33.52 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  31.84 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  30.56 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  29.63 
 
 		 499 aa  84.7  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  31.16 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  30.77 
 
 		 451 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  33.15 
 
 		 464 aa  84.3  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 		 471 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 		 437 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  36.52 
 
 		 459 aa  84  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1744 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  30 
 
 		 760 aa  83.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  33.05 
 
 		 263 aa  83.2  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  30.16 
 
 		 451 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  37.67 
 
 		 601 aa  83.2  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  33.04 
 
 		 249 aa  82.8  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  35.57 
 
 		 149 aa  82  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  30.68 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  29.41 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  34.5 
 
 		 972 aa  81.6  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  33.85 
 
 		 2324 aa  81.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  32.6 
 
 		 490 aa  81.3  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  30.39 
 
 		 802 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  29.3 
 
 		 716 aa  80.1  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>