235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1854 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
440 aa  884    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  64.93 
 
 
445 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  63.88 
 
 
445 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  62.21 
 
 
460 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  60.73 
 
 
441 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  61.87 
 
 
469 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  62.56 
 
 
471 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  60.73 
 
 
437 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  60.73 
 
 
437 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  61.19 
 
 
437 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  60.23 
 
 
437 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  60.09 
 
 
446 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  59.95 
 
 
434 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  60.18 
 
 
436 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  59.68 
 
 
499 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  59.13 
 
 
440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  55.82 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  58.86 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  50.33 
 
 
451 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  49.1 
 
 
447 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  49.22 
 
 
451 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  49.67 
 
 
451 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  49.45 
 
 
451 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  49.89 
 
 
447 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  49.66 
 
 
447 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  54.35 
 
 
439 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  49.89 
 
 
446 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  52.06 
 
 
444 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  49.1 
 
 
453 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  53.21 
 
 
437 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  48.51 
 
 
439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  56.53 
 
 
450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  50.92 
 
 
432 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  51.13 
 
 
473 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  51.37 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  46.52 
 
 
441 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  45.92 
 
 
475 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  45.99 
 
 
490 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  44.84 
 
 
459 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  46.72 
 
 
413 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  45.78 
 
 
412 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  46.84 
 
 
414 aa  359  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  46.58 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  47.75 
 
 
421 aa  356  5e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  47.21 
 
 
414 aa  353  4e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  46.02 
 
 
436 aa  348  8e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  38.85 
 
 
484 aa  275  9e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  38.86 
 
 
432 aa  251  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  35.07 
 
 
1263 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  34.83 
 
 
416 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  34.69 
 
 
508 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  35 
 
 
937 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.14 
 
 
892 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  35.44 
 
 
482 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  35 
 
 
937 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.74 
 
 
1041 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  32.19 
 
 
354 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.92 
 
 
863 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  29.29 
 
 
307 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.29 
 
 
1107 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.46 
 
 
867 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  30.73 
 
 
296 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  30.86 
 
 
1015 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  35.71 
 
 
761 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  35.42 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.14 
 
 
305 aa  72  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.77 
 
 
472 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.76 
 
 
476 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  30.9 
 
 
886 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  29.35 
 
 
713 aa  70.1  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  28.57 
 
 
242 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  25.56 
 
 
757 aa  66.6  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.38 
 
 
1024 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  32.8 
 
 
291 aa  63.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  26.63 
 
 
263 aa  60.1  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  23.5 
 
 
1749 aa  59.7  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  27.43 
 
 
559 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  24.43 
 
 
2491 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  27.92 
 
 
467 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  32.35 
 
 
334 aa  57  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.06 
 
 
746 aa  57  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 
612 aa  57  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  32.65 
 
 
788 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  32.65 
 
 
788 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  29.52 
 
 
763 aa  56.6  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  32.52 
 
 
1744 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  21.23 
 
 
204 aa  56.6  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  33.61 
 
 
675 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  30.95 
 
 
528 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  31.16 
 
 
1494 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  28.19 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  40.54 
 
 
149 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  31.67 
 
 
648 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  20.7 
 
 
925 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  22.14 
 
 
1344 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3040  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  32.65 
 
 
788 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  29.19 
 
 
443 aa  55.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  27.78 
 
 
293 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  29.93 
 
 
1498 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>