127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1837 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  34.86 
 
 		 1481 aa  704    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  34.58 
 
 		 1481 aa  707    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1494 aa  2980    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  36.22 
 
 		 1508 aa  724    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1495 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1498 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1497 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  29.62 
 
 		 1496 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1498 aa  453  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  28.14 
 
 		 1439 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1439 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  28.83 
 
 		 1473 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1376 aa  376  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  28.91 
 
 		 1473 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1459 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  31.77 
 
 		 1634 aa  298  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1744 aa  297  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  31.49 
 
 		 1631 aa  290  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  29.52 
 
 		 1611 aa  290  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  33.97 
 
 		 1395 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  32.96 
 
 		 1395 aa  259  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  32.81 
 
 		 1393 aa  259  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1262 aa  246  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1690 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1847 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1608 aa  241  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1593 aa  209  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1275 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1640 aa  196  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  26.16 
 
 		 1984 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  26.04 
 
 		 2580 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1990 aa  174  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1680 aa  149  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1489 aa  147  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1625 aa  132  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  28.73 
 
 		 755 aa  110  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  25.83 
 
 		 971 aa  108  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  28.48 
 
 		 755 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  28.48 
 
 		 755 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  28.48 
 
 		 731 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  27.56 
 
 		 568 aa  102  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  27.29 
 
 		 574 aa  100  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  26.79 
 
 		 583 aa  100  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  28.54 
 
 		 443 aa  99.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  28.13 
 
 		 547 aa  99.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  28.31 
 
 		 545 aa  97.8  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  26.72 
 
 		 565 aa  96.3  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  27.99 
 
 		 776 aa  95.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  28.19 
 
 		 765 aa  92  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  25.61 
 
 		 788 aa  89.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  29.03 
 
 		 575 aa  89.4  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  25.78 
 
 		 788 aa  87.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  25.39 
 
 		 788 aa  87  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  25.24 
 
 		 603 aa  85.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  28.2 
 
 		 615 aa  78.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  33.55 
 
 		 1041 aa  73.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 		 622 aa  72.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  26.03 
 
 		 863 aa  67.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  34.81 
 
 		 1263 aa  65.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  30.56 
 
 		 508 aa  63.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  30.81 
 
 		 1015 aa  62  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  32.39 
 
 		 757 aa  61.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.1 
 
 		 482 aa  61.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.92 
 
 		 1107 aa  60.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  25.27 
 
 		 713 aa  59.3  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  32.44 
 
 		 648 aa  58.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  37.61 
 
 		 354 aa  58.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 		 412 aa  57.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  28.9 
 
 		 414 aa  57.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62257  predicted protein  34.15 
 
 		 854 aa  56.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.374999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  30.99 
 
 		 307 aa  56.2  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 		 440 aa  56.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4631  leucine-rich repeat-containing protein  42.31 
 
 		 473 aa  56.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  27.59 
 
 		 291 aa  55.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32 
 
 		 867 aa  55.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1349  hypothetical protein  27.14 
 
 		 634 aa  55.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.85 
 
 		 937 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  30.19 
 
 		 436 aa  53.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  29.01 
 
 		 2198 aa  53.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.85 
 
 		 937 aa  53.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  32.88 
 
 		 413 aa  53.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 445 aa  53.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  27.33 
 
 		 467 aa  53.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4632  hypothetical protein  50 
 
 		 499 aa  53.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  32.75 
 
 		 434 aa  52.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  27.74 
 
 		 886 aa  52.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  32.71 
 
 		 892 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.09 
 
 		 472 aa  51.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  26.88 
 
 		 1749 aa  51.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 		 459 aa  51.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  31.58 
 
 		 1266 aa  50.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  28 
 
 		 1024 aa  50.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 		 445 aa  51.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  32.69 
 
 		 242 aa  50.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  34.57 
 
 		 416 aa  50.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 		 475 aa  50.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  35.04 
 
 		 469 aa  49.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  36.09 
 
 		 441 aa  48.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 453 aa  48.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  33.33 
 
 		 375 aa  48.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>