47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3302 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1489 aa  3001    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  42.14 
 
 		 1690 aa  586  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  42.02 
 
 		 1680 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  43.15 
 
 		 1625 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  30.98 
 
 		 1262 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1393 aa  295  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1395 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1395 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1275 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  28.69 
 
 		 1608 aa  238  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  28.68 
 
 		 1634 aa  220  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1631 aa  210  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  27.99 
 
 		 1984 aa  206  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1990 aa  195  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  37.85 
 
 		 1593 aa  195  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  28.33 
 
 		 1611 aa  192  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  29.74 
 
 		 1497 aa  189  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1439 aa  183  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  29.49 
 
 		 1496 aa  181  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1439 aa  180  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  25.68 
 
 		 2580 aa  172  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1498 aa  171  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1847 aa  171  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  28.55 
 
 		 1473 aa  153  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1495 aa  153  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1640 aa  149  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1473 aa  149  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1498 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  29.18 
 
 		 1494 aa  144  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  27.72 
 
 		 971 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1459 aa  140  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1481 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  25.88 
 
 		 1481 aa  136  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1744 aa  135  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1376 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1508 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.17 
 
 		 1107 aa  60.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.86 
 
 		 508 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  28.37 
 
 		 1041 aa  51.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  28.35 
 
 		 467 aa  51.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  32.8 
 
 		 1015 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  31.58 
 
 		 354 aa  50.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.44 
 
 		 1263 aa  48.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  24.69 
 
 		 972 aa  48.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  29.9 
 
 		 482 aa  47  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  26.99 
 
 		 1024 aa  46.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  24.14 
 
 		 1749 aa  45.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>