43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2968 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1625 aa  3293    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  60.38 
 
 		 1680 aa  1941    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  60.26 
 
 		 1690 aa  1938    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  43.15 
 
 		 1489 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  30.52 
 
 		 1984 aa  313  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  32.72 
 
 		 1262 aa  305  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  28.59 
 
 		 1990 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  27.28 
 
 		 1631 aa  265  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  28.41 
 
 		 1640 aa  262  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  26.29 
 
 		 1634 aa  259  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.65 
 
 		 1611 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  26.11 
 
 		 2580 aa  227  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1275 aa  227  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  28.53 
 
 		 1497 aa  207  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1608 aa  207  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  27.71 
 
 		 1496 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1593 aa  193  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1498 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1498 aa  190  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  29.69 
 
 		 1847 aa  190  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1473 aa  184  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  28.8 
 
 		 1473 aa  178  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  30.47 
 
 		 1393 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1495 aa  174  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  30.55 
 
 		 1395 aa  167  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  27.2 
 
 		 971 aa  155  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  29.98 
 
 		 1395 aa  155  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1439 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1439 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1481 aa  143  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1459 aa  139  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1481 aa  139  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1494 aa  135  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1376 aa  134  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1508 aa  133  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1744 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  27.44 
 
 		 1041 aa  55.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  22.89 
 
 		 574 aa  48.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  27.5 
 
 		 508 aa  47.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.15 
 
 		 1263 aa  47.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.43 
 
 		 354 aa  47.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  27.32 
 
 		 757 aa  47  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  26.5 
 
 		 1024 aa  47  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>