79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2394 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  40.63 
 
 		 1496 aa  927    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  93.89 
 
 		 1473 aa  2699    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1473 aa  2972    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  41.71 
 
 		 1497 aa  940    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  43.28 
 
 		 1495 aa  966    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  41.02 
 
 		 1498 aa  930    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  40.68 
 
 		 1498 aa  903    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  28.25 
 
 		 1395 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  28.76 
 
 		 1393 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1395 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  28.45 
 
 		 1494 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1439 aa  363  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1459 aa  351  7e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1439 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  27.68 
 
 		 1631 aa  340  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1508 aa  330  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1376 aa  326  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1481 aa  321  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1481 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1611 aa  300  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  28.11 
 
 		 1275 aa  276  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1744 aa  271  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1593 aa  261  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1262 aa  233  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  29.66 
 
 		 1690 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1847 aa  199  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  28.28 
 
 		 1634 aa  194  9e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  29.5 
 
 		 1680 aa  194  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  28.8 
 
 		 1625 aa  190  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  27.4 
 
 		 1984 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  25.54 
 
 		 2580 aa  186  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1990 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1489 aa  167  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1640 aa  162  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1608 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  22.62 
 
 		 971 aa  101  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  26.07 
 
 		 574 aa  81.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  26.75 
 
 		 615 aa  79.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  24.38 
 
 		 565 aa  75.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  23.71 
 
 		 575 aa  72.8  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  23.3 
 
 		 583 aa  71.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  26.13 
 
 		 622 aa  71.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  24.77 
 
 		 545 aa  70.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  27.07 
 
 		 776 aa  70.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  24.16 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  23.81 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  24.83 
 
 		 547 aa  66.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  23.41 
 
 		 568 aa  65.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  25.37 
 
 		 788 aa  63.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  25.36 
 
 		 788 aa  63.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  25.36 
 
 		 788 aa  62.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.36 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.78 
 
 		 1344 aa  59.3  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.52 
 
 		 1015 aa  57  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.56 
 
 		 1263 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  29.87 
 
 		 307 aa  52.4  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.72 
 
 		 1749 aa  52.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  26.97 
 
 		 1041 aa  52  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  28.24 
 
 		 2132 aa  50.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  33.97 
 
 		 1266 aa  50.1  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.63 
 
 		 1107 aa  49.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  28.08 
 
 		 508 aa  49.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  26.9 
 
 		 421 aa  48.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 444 aa  47.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  27.44 
 
 		 448 aa  48.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  23.08 
 
 		 925 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  25.29 
 
 		 863 aa  48.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  35.56 
 
 		 559 aa  47.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  28.89 
 
 		 892 aa  47.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  25.43 
 
 		 467 aa  47  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 		 439 aa  47  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  29.58 
 
 		 412 aa  46.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  28 
 
 		 414 aa  45.8  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  28.17 
 
 		 414 aa  45.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 		 444 aa  45.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  29.08 
 
 		 396 aa  45.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  30.13 
 
 		 937 aa  45.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 475 aa  45.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 		 473 aa  45.1  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>