84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0253 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  100 
 
 		 545 aa  1117    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  75 
 
 		 547 aa  806    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  73.76 
 
 		 583 aa  835    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  78.17 
 
 		 568 aa  879    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  64.32 
 
 		 603 aa  694    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  68.09 
 
 		 575 aa  737    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  73.67 
 
 		 565 aa  807    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  68.5 
 
 		 574 aa  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  79.31 
 
 		 443 aa  733    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  38.8 
 
 		 615 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  37.6 
 
 		 755 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  37.6 
 
 		 731 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  37.6 
 
 		 755 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  37.09 
 
 		 755 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  38.32 
 
 		 622 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  40.92 
 
 		 776 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  41.21 
 
 		 788 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  41.21 
 
 		 788 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  41.21 
 
 		 788 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  36.33 
 
 		 765 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  35.07 
 
 		 301 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  34.62 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  30.96 
 
 		 323 aa  107  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  29.09 
 
 		 375 aa  97.4  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  40 
 
 		 284 aa  96.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  31.3 
 
 		 388 aa  91.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  37.23 
 
 		 763 aa  87.8  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1498 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1495 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  41.01 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  26 
 
 		 1494 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1497 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1611 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  41.91 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1496 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1459 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1498 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  34.21 
 
 		 863 aa  71.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1473 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1439 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  22.7 
 
 		 1473 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  28.07 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  33.04 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1376 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1481 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  23.76 
 
 		 1640 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  33.93 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1439 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1481 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  22.95 
 
 		 1984 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1395 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  24.81 
 
 		 1634 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  30.37 
 
 		 1393 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1413  hypothetical protein  31.48 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173619  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2764  hypothetical protein  31.48 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00341411  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1631 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1395 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1744 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1508 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  23.72 
 
 		 1990 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  32.56 
 
 		 892 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.22 
 
 		 1041 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  30.24 
 
 		 419 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  33.11 
 
 		 296 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  35.93 
 
 		 972 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.53 
 
 		 1015 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.9 
 
 		 1263 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.25 
 
 		 713 aa  51.6  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  31.54 
 
 		 937 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  29.75 
 
 		 1749 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  32.18 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  29.72 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  32.92 
 
 		 508 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  32.72 
 
 		 565 aa  47.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  31.54 
 
 		 937 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.49 
 
 		 1344 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  32.2 
 
 		 2198 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.06 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2788  leucine-rich repeat protein  30.07 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  22.77 
 
 		 1680 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 		 453 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  28.03 
 
 		 350 aa  44.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.89 
 
 		 1107 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 432 aa  43.5  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>