88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0713 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  100 
 
 		 443 aa  906    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  79.31 
 
 		 545 aa  733    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  87.21 
 
 		 574 aa  754    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  79.66 
 
 		 565 aa  734    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  75.27 
 
 		 575 aa  679    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  71.91 
 
 		 603 aa  650    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  78.94 
 
 		 568 aa  733    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  85.29 
 
 		 583 aa  751    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  81.21 
 
 		 547 aa  734    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  44.34 
 
 		 776 aa  346  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  44.42 
 
 		 755 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  44.19 
 
 		 731 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  44.19 
 
 		 755 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  44.19 
 
 		 755 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  43.91 
 
 		 788 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  43.91 
 
 		 788 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  43.91 
 
 		 788 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  43.41 
 
 		 615 aa  335  7.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  41.82 
 
 		 765 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  41.16 
 
 		 622 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1495 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  30.77 
 
 		 323 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  26.02 
 
 		 1494 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1611 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  48.42 
 
 		 581 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1498 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  39.72 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1497 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1496 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  27.69 
 
 		 1439 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1459 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  27.99 
 
 		 1395 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  24.14 
 
 		 1984 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  28.24 
 
 		 1395 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1439 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  24.16 
 
 		 1473 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1473 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1498 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  43.97 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  28.94 
 
 		 1393 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  27.86 
 
 		 375 aa  67  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  40.3 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  22.75 
 
 		 1640 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  37.93 
 
 		 763 aa  60.5  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1481 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1376 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  44.44 
 
 		 284 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.59 
 
 		 863 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  30.11 
 
 		 1634 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  22.01 
 
 		 1990 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.24 
 
 		 1041 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  25.51 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  31.14 
 
 		 1631 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1744 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  33.11 
 
 		 535 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1481 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  23.86 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  34.56 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  37.29 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  42.31 
 
 		 508 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  36.79 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  37.61 
 
 		 482 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  37.5 
 
 		 565 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  35.9 
 
 		 416 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  23.2 
 
 		 1680 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  30.56 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.81 
 
 		 892 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1508 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  37.61 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  36.79 
 
 		 475 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  36.15 
 
 		 1015 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  39.13 
 
 		 1263 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  32.52 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  35.16 
 
 		 713 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  35.34 
 
 		 886 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 		 437 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  35.25 
 
 		 937 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  37.61 
 
 		 761 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  22.93 
 
 		 1690 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  33.65 
 
 		 757 aa  43.9  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  38.26 
 
 		 867 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  32.77 
 
 		 296 aa  43.1  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  35.25 
 
 		 937 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1349  hypothetical protein  23.67 
 
 		 634 aa  43.1  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>