296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4909 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  100 
 
 
1015 aa  2068    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  64.58 
 
 
748 aa  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  57.6 
 
 
1041 aa  936    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  39.07 
 
 
863 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  38.19 
 
 
892 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.35 
 
 
1107 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  37.13 
 
 
886 aa  435  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  37.45 
 
 
925 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  34.87 
 
 
867 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  34 
 
 
937 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  34.12 
 
 
937 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  29.23 
 
 
761 aa  265  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1587  TIR protein  62.22 
 
 
275 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0118312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  55.32 
 
 
951 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  27.59 
 
 
811 aa  206  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  42.49 
 
 
482 aa  182  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  26.31 
 
 
1085 aa  178  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  43.08 
 
 
416 aa  171  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  41.67 
 
 
1263 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  38.46 
 
 
508 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  39.02 
 
 
354 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  34.92 
 
 
1266 aa  143  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  34.5 
 
 
1749 aa  139  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  33.54 
 
 
713 aa  132  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  38.19 
 
 
757 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  38.01 
 
 
448 aa  121  6e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  37.89 
 
 
307 aa  119  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  35.03 
 
 
296 aa  111  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  45.12 
 
 
1744 aa  110  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  36.2 
 
 
242 aa  108  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  37.28 
 
 
2491 aa  107  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  28.21 
 
 
1344 aa  107  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.98 
 
 
476 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.02 
 
 
472 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  35.69 
 
 
615 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  33.94 
 
 
776 aa  103  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  33.2 
 
 
2132 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  33.82 
 
 
788 aa  100  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 
437 aa  100  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  33.91 
 
 
788 aa  99  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  33.53 
 
 
788 aa  98.2  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  34.1 
 
 
755 aa  98.2  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  30.3 
 
 
998 aa  97.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  31.9 
 
 
1024 aa  96.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  36.81 
 
 
460 aa  96.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  34.45 
 
 
755 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  34.45 
 
 
755 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  34.45 
 
 
731 aa  96.3  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  36.6 
 
 
439 aa  94.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  36.29 
 
 
765 aa  94  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  37.04 
 
 
447 aa  94  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  35.96 
 
 
459 aa  93.2  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  31.06 
 
 
467 aa  93.6  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  36.93 
 
 
447 aa  93.6  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
453 aa  93.6  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
437 aa  92  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
437 aa  92  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  36.36 
 
 
447 aa  91.3  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  34.24 
 
 
421 aa  90.5  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  35.58 
 
 
413 aa  90.9  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  33.93 
 
 
293 aa  89.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  36.2 
 
 
451 aa  89.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
412 aa  90.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  36.42 
 
 
446 aa  89.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 
437 aa  88.6  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  36.2 
 
 
451 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  33.51 
 
 
445 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  29.96 
 
 
396 aa  87.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  34.66 
 
 
414 aa  87.4  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  34.97 
 
 
451 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  35.2 
 
 
464 aa  86.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  34.45 
 
 
622 aa  86.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  34.97 
 
 
451 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  41.1 
 
 
291 aa  86.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  38.5 
 
 
478 aa  85.9  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  37.04 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  34.46 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  29.96 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  33.74 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  31.17 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  35.59 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  33.53 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  32.13 
 
 
446 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  33.33 
 
 
414 aa  84.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  35.58 
 
 
490 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  30.96 
 
 
484 aa  83.2  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  33.74 
 
 
469 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  33.78 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0747  hypothetical protein  29.35 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.509799 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  32.1 
 
 
204 aa  82.4  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  33.73 
 
 
444 aa  82  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  33.51 
 
 
802 aa  82  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  35.06 
 
 
473 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  34.91 
 
 
559 aa  80.9  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  35.59 
 
 
772 aa  80.1  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  37.71 
 
 
347 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  32.46 
 
 
499 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>