84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1476 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  100 
 
 		 998 aa  2021    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.13 
 
 		 863 aa  127  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.39 
 
 		 892 aa  114  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.25 
 
 		 1107 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  31 
 
 		 1015 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  30.36 
 
 		 886 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  21.72 
 
 		 925 aa  104  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.4 
 
 		 1041 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  23.5 
 
 		 937 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  23.5 
 
 		 937 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  26.2 
 
 		 1266 aa  100  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  30.64 
 
 		 867 aa  97.8  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  23.89 
 
 		 1085 aa  94  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  28.57 
 
 		 811 aa  82  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  39.81 
 
 		 1070 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  39.81 
 
 		 1070 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  39.81 
 
 		 1112 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  25.65 
 
 		 761 aa  75.5  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  31.69 
 
 		 766 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  27.13 
 
 		 531 aa  71.6  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  38.17 
 
 		 341 aa  71.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  31.69 
 
 		 760 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  31.82 
 
 		 755 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  31.82 
 
 		 765 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  31.82 
 
 		 779 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  31.82 
 
 		 766 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1351 aa  69.7  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  31.82 
 
 		 772 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  30.1 
 
 		 877 aa  69.7  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  31.82 
 
 		 542 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  30.99 
 
 		 760 aa  69.3  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  38.38 
 
 		 1088 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  37.96 
 
 		 993 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  37.04 
 
 		 994 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  31.31 
 
 		 858 aa  65.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 772 aa  65.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  34.55 
 
 		 1052 aa  65.1  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  28.85 
 
 		 995 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  30.6 
 
 		 1011 aa  61.6  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  30.19 
 
 		 954 aa  60.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  36.11 
 
 		 1012 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  36.27 
 
 		 348 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  36.27 
 
 		 348 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  37.74 
 
 		 347 aa  57.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  24.82 
 
 		 643 aa  57  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  31.21 
 
 		 587 aa  56.6  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  31.9 
 
 		 2198 aa  57  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  34.83 
 
 		 356 aa  57  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 789 aa  55.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6120  hypothetical protein  27.88 
 
 		 211 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 789 aa  55.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  35.29 
 
 		 748 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  38.64 
 
 		 692 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  26.49 
 
 		 355 aa  53.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  31.21 
 
 		 384 aa  52.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  27.27 
 
 		 400 aa  52.4  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  30 
 
 		 284 aa  52  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  32.65 
 
 		 205 aa  51.6  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  29.7 
 
 		 565 aa  51.2  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  34.34 
 
 		 197 aa  50.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  28.3 
 
 		 539 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  28.35 
 
 		 467 aa  51.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  25.23 
 
 		 421 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  36.36 
 
 		 935 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  29.91 
 
 		 399 aa  49.3  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  27.06 
 
 		 776 aa  49.3  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  30 
 
 		 972 aa  48.5  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  24.2 
 
 		 388 aa  47.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  23.23 
 
 		 1473 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  29.32 
 
 		 400 aa  47.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  30.47 
 
 		 791 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  26.19 
 
 		 498 aa  47  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  28 
 
 		 399 aa  46.2  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  33.33 
 
 		 765 aa  46.6  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  36.92 
 
 		 1086 aa  46.2  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34969  predicted protein  36.89 
 
 		 757 aa  46.2  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.544485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.59 
 
 		 508 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  23.73 
 
 		 2580 aa  45.8  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  32.05 
 
 		 2324 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  33.12 
 
 		 631 aa  45.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  37.21 
 
 		 1344 aa  45.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  38.37 
 
 		 482 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  26.23 
 
 		 528 aa  44.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1275 aa  44.7  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>