189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0875 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0875  POPC protein  100 
 
 		 1024 aa  2048    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  34.74 
 
 		 1263 aa  175  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  32.34 
 
 		 757 aa  174  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  34.47 
 
 		 482 aa  173  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  34.4 
 
 		 508 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  38.08 
 
 		 1041 aa  155  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  34.74 
 
 		 416 aa  145  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  36.01 
 
 		 867 aa  144  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.94 
 
 		 1107 aa  140  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.43 
 
 		 354 aa  129  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.7 
 
 		 937 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.7 
 
 		 937 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  37.05 
 
 		 892 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  26.99 
 
 		 713 aa  118  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  31.11 
 
 		 648 aa  106  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 863 aa  105  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  28.95 
 
 		 2491 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.05 
 
 		 1344 aa  100  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  28.94 
 
 		 559 aa  98.6  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  28.74 
 
 		 1749 aa  97.8  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  36.87 
 
 		 307 aa  96.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  31.9 
 
 		 1015 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.82 
 
 		 886 aa  92  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  29.23 
 
 		 526 aa  92  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.21 
 
 		 476 aa  87.8  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  37.93 
 
 		 478 aa  86.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  30.53 
 
 		 296 aa  86.3  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  35 
 
 		 656 aa  85.1  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  30.57 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.14 
 
 		 1266 aa  83.6  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  27.42 
 
 		 1085 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  26.52 
 
 		 972 aa  80.5  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  26.01 
 
 		 2324 aa  79.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  31.49 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.16 
 
 		 472 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  38.85 
 
 		 291 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  24.94 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  25.8 
 
 		 558 aa  75.5  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  22.91 
 
 		 569 aa  75.5  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  37.16 
 
 		 761 aa  74.7  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  28.9 
 
 		 601 aa  74.7  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  26.06 
 
 		 2132 aa  73.9  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  32.34 
 
 		 1395 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  28.15 
 
 		 528 aa  72.8  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  31.91 
 
 		 247 aa  72  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  30.26 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  32.79 
 
 		 1395 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  26.12 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.9 
 
 		 653 aa  69.3  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1831  hypothetical protein  26.9 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  28.4 
 
 		 685 aa  68.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  28.99 
 
 		 1088 aa  68.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  26.27 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  34.55 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  25.99 
 
 		 580 aa  67.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  30.85 
 
 		 1393 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  29.26 
 
 		 434 aa  67  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  29.47 
 
 		 716 aa  66.6  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  26.48 
 
 		 925 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  31.4 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  27.6 
 
 		 1012 aa  65.1  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  31.18 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  34.84 
 
 		 776 aa  65.1  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  27.13 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  26.85 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  24.74 
 
 		 640 aa  64.7  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  31.37 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 		 440 aa  64.3  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  28.57 
 
 		 899 aa  64.3  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  30.65 
 
 		 543 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  30.99 
 
 		 413 aa  63.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  25.96 
 
 		 772 aa  63.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  31.05 
 
 		 304 aa  63.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  26.17 
 
 		 802 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  29.38 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  30.82 
 
 		 788 aa  62.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  30.67 
 
 		 149 aa  62.4  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  30.82 
 
 		 788 aa  62.4  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  30.93 
 
 		 788 aa  62  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 		 475 aa  62  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  33.53 
 
 		 446 aa  62  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 453 aa  62  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  27.03 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  28.09 
 
 		 446 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  27.73 
 
 		 1012 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  25.99 
 
 		 414 aa  60.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  27.73 
 
 		 954 aa  60.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  29.17 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 421 aa  60.1  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  26.02 
 
 		 293 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 		 471 aa  60.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>