103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39088 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  100 
 
 
685 aa  1379    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39117  predicted protein  39.58 
 
 
587 aa  333  6e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294419  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  28.44 
 
 
716 aa  204  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  32.66 
 
 
2491 aa  198  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  37.95 
 
 
304 aa  195  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  28.88 
 
 
1017 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43724  predicted protein  30.92 
 
 
890 aa  156  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  30.97 
 
 
1012 aa  153  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1196  predicted protein  30.96 
 
 
304 aa  144  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  35.58 
 
 
1000 aa  140  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  30.97 
 
 
454 aa  139  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49769  predicted protein  28.19 
 
 
593 aa  139  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49671  predicted protein  31.16 
 
 
454 aa  136  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.245553  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  40.45 
 
 
526 aa  133  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  29.15 
 
 
601 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  27.86 
 
 
640 aa  127  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12909  predicted protein  32.94 
 
 
258 aa  124  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38108  predicted protein  29.74 
 
 
461 aa  124  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  26.39 
 
 
899 aa  123  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  31.49 
 
 
283 aa  121  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45679  predicted protein  27.2 
 
 
682 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  31 
 
 
249 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  32.8 
 
 
247 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44315  predicted protein  27.64 
 
 
348 aa  110  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  35.24 
 
 
230 aa  110  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1379  predicted protein  32.06 
 
 
350 aa  107  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.815814  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  26.77 
 
 
633 aa  104  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  35.41 
 
 
334 aa  103  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33901  predicted protein  29.62 
 
 
596 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530565  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44441  predicted protein  26.21 
 
 
4500 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  33.84 
 
 
263 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  27 
 
 
447 aa  96.3  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.82 
 
 
1107 aa  92.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  28.34 
 
 
482 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4339  predicted protein  31.67 
 
 
222 aa  89.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00625498  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  34.26 
 
 
1041 aa  88.2  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  48.65 
 
 
2449 aa  86.3  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4344  predicted protein  34.38 
 
 
169 aa  86.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22559  predicted protein  41.67 
 
 
159 aa  82.8  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.509446  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49989  predicted protein  30.45 
 
 
1498 aa  82  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49666  predicted protein  25.51 
 
 
540 aa  80.1  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86229  predicted protein  29.18 
 
 
497 aa  79  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46793  predicted protein  28.28 
 
 
329 aa  79  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46212  predicted protein  30.04 
 
 
768 aa  78.2  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.32 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  28.03 
 
 
543 aa  78.2  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46795  predicted protein  27.16 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0217893  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_6311  predicted protein  40.18 
 
 
127 aa  77.8  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  30.13 
 
 
863 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1865  leucine-rich repeat-containing protein  28.41 
 
 
237 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.956378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  32.62 
 
 
2324 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11423  predicted protein  36.09 
 
 
168 aa  70.5  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335216  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.04 
 
 
892 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  32.52 
 
 
1263 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  30.23 
 
 
1024 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  28.31 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  26.27 
 
 
1290 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  27.42 
 
 
757 aa  65.1  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  30.21 
 
 
307 aa  63.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  29.77 
 
 
2397 aa  60.8  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  26.26 
 
 
648 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  22.6 
 
 
1749 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01870  conserved hypothetical protein  28.51 
 
 
840 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.84 
 
 
886 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18438  predicted protein  25 
 
 
512 aa  59.7  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15749  predicted protein  35.44 
 
 
81 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00765977  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  30.49 
 
 
1015 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  28.15 
 
 
867 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  30.84 
 
 
416 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.63 
 
 
713 aa  56.2  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.98 
 
 
937 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.61 
 
 
476 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  26.21 
 
 
242 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.98 
 
 
937 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  28.89 
 
 
972 aa  53.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  49.25 
 
 
793 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.75 
 
 
1344 aa  52  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  35.23 
 
 
682 aa  50.8  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  33.53 
 
 
761 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35840  hypothetical protein  40.66 
 
 
606 aa  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2836  peptidoglycan-binding LysM  37.31 
 
 
583 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00147111  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  32.35 
 
 
1142 aa  49.3  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  27.56 
 
 
521 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  28.57 
 
 
653 aa  48.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  43.66 
 
 
1788 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  25.54 
 
 
204 aa  47.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  46.67 
 
 
1594 aa  47.4  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  34.01 
 
 
1439 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.71 
 
 
451 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 
451 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  32.05 
 
 
1070 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  30 
 
 
434 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  32.05 
 
 
1070 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  27.66 
 
 
451 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1469  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.5 
 
 
3689 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  29.73 
 
 
643 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  33.97 
 
 
1439 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  46.58 
 
 
347 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  46.58 
 
 
347 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.12 
 
 
653 aa  45.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>