More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3380 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  87.53 
 
 
441 aa  752    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
437 aa  872    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  98.17 
 
 
437 aa  859    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  84.93 
 
 
471 aa  723    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  85.16 
 
 
469 aa  707    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
437 aa  872    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  80.83 
 
 
460 aa  667    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  67.27 
 
 
445 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  66.29 
 
 
445 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  60.73 
 
 
440 aa  505  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  61.38 
 
 
436 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  60.23 
 
 
437 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  57.41 
 
 
434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  57.05 
 
 
464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  58.03 
 
 
499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  52.52 
 
 
439 aa  444  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  55.96 
 
 
438 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  58.6 
 
 
440 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  55.91 
 
 
446 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  57.31 
 
 
450 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  50.23 
 
 
447 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  55.13 
 
 
444 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  49.56 
 
 
451 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  49.78 
 
 
451 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  49.78 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  49.33 
 
 
451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  53.47 
 
 
432 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  55.37 
 
 
439 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  50.91 
 
 
446 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  54.48 
 
 
473 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  54.48 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  48.99 
 
 
447 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  48.44 
 
 
453 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  45.92 
 
 
475 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  46.74 
 
 
459 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  48.54 
 
 
447 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  46.62 
 
 
441 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  53.12 
 
 
437 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  46.24 
 
 
490 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  48.29 
 
 
412 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  48.18 
 
 
414 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  45.24 
 
 
436 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  47.87 
 
 
413 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  46.62 
 
 
414 aa  359  5e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  43.61 
 
 
396 aa  354  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  46.85 
 
 
421 aa  352  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  40.91 
 
 
484 aa  271  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  38.62 
 
 
432 aa  237  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  28.37 
 
 
1041 aa  96.7  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  32.69 
 
 
1263 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.48 
 
 
1015 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.04 
 
 
863 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  38.12 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  32.39 
 
 
482 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  37.04 
 
 
508 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.65 
 
 
892 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  29.85 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  34.48 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.48 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  31.55 
 
 
937 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.57 
 
 
1107 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.7 
 
 
937 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.9 
 
 
886 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  31.03 
 
 
761 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.51 
 
 
867 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  30.06 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.09 
 
 
476 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  27.37 
 
 
757 aa  67.4  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  24.42 
 
 
713 aa  66.6  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  31.18 
 
 
1024 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.01 
 
 
627 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.24 
 
 
305 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.13 
 
 
650 aa  63.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  30.29 
 
 
1018 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51279  predicted protein  30.23 
 
 
298 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32826  predicted protein  26.34 
 
 
355 aa  61.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.146884  normal  0.518532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.01 
 
 
472 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04290  protein kinase, putative  27.95 
 
 
573 aa  60.8  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0054946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  32.87 
 
 
291 aa  60.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  19.02 
 
 
204 aa  60.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
612 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25 
 
 
1344 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  26.79 
 
 
1749 aa  59.3  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  31.78 
 
 
963 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  29.69 
 
 
755 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  30.77 
 
 
648 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  30.1 
 
 
230 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  31.87 
 
 
448 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57744  predicted protein  24.1 
 
 
893 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151304  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  26.45 
 
 
559 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  32.93 
 
 
494 aa  57  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  31.96 
 
 
1088 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21961  predicted protein  25.89 
 
 
320 aa  57  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  31.41 
 
 
1744 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  22.04 
 
 
925 aa  56.6  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  33.52 
 
 
601 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  28.49 
 
 
763 aa  56.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  30.99 
 
 
615 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  23.89 
 
 
384 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1642  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
500 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.465473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>