156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0949 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  95.23 
 
 		 755 aa  1476    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  92.55 
 
 		 765 aa  1421    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  100 
 
 		 755 aa  1555    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  95.1 
 
 		 755 aa  1474    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  94.94 
 
 		 731 aa  1430    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  41.49 
 
 		 788 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  41.49 
 
 		 788 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  41.61 
 
 		 788 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  41.47 
 
 		 776 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  40.76 
 
 		 615 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  39.39 
 
 		 622 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  40.23 
 
 		 574 aa  398  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  38.02 
 
 		 545 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  42.83 
 
 		 568 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  37.5 
 
 		 583 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  42.43 
 
 		 565 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  41.37 
 
 		 547 aa  354  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  44.42 
 
 		 443 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  36.67 
 
 		 575 aa  342  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  36.23 
 
 		 603 aa  333  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  37.5 
 
 		 301 aa  183  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  35.76 
 
 		 318 aa  175  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  37.63 
 
 		 284 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  34.89 
 
 		 388 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  26.54 
 
 		 375 aa  114  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  35.94 
 
 		 1041 aa  111  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  37.67 
 
 		 581 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.1 
 
 		 1015 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.06 
 
 		 863 aa  94  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1126  secreted effector protein  42.99 
 
 		 322 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1092  secreted effector protein  42.99 
 
 		 322 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  27.35 
 
 		 1494 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  28.46 
 
 		 323 aa  91.3  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.19 
 
 		 508 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  30.35 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  27.27 
 
 		 763 aa  84  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  32.17 
 
 		 416 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.34 
 
 		 482 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1393 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.75 
 
 		 1263 aa  77.4  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  24.81 
 
 		 1611 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  32.31 
 
 		 499 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1495 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  24.07 
 
 		 1395 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  28.38 
 
 		 424 aa  70.5  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.84 
 
 		 1107 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 		 450 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  30.46 
 
 		 631 aa  69.3  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  29.44 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  32.35 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  24.72 
 
 		 1344 aa  66.6  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  25.4 
 
 		 867 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.38 
 
 		 892 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1395 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  28.8 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1640 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1481 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  32.04 
 
 		 757 aa  63.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  26.19 
 
 		 713 aa  63.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 		 447 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  30.21 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  29.5 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.69 
 
 		 1679 aa  60.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1497 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  30 
 
 		 447 aa  60.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1498 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1459 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  28.8 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  31.76 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  30.32 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  28.43 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  34.62 
 
 		 761 aa  58.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  30.99 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  27.19 
 
 		 618 aa  57.8  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  29.6 
 
 		 937 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  29 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  26.11 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1481 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  29.6 
 
 		 937 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  31.11 
 
 		 448 aa  57  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1439 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 		 436 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 		 453 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  29.94 
 
 		 413 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1376 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  27.59 
 
 		 401 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 437 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1439 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 459 aa  55.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  29.44 
 
 		 451 aa  55.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1508 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  28.74 
 
 		 816 aa  54.7  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  32.79 
 
 		 464 aa  54.7  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  30.73 
 
 		 434 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>