89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0130 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  79.66 
 
 		 443 aa  734    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  72.47 
 
 		 575 aa  783    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  100 
 
 		 565 aa  1162    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  72.37 
 
 		 574 aa  782    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  73.45 
 
 		 545 aa  806    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  64.66 
 
 		 603 aa  708    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  72.76 
 
 		 568 aa  797    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  73.07 
 
 		 583 aa  814    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  71.78 
 
 		 547 aa  792    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  43.97 
 
 		 788 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  43.97 
 
 		 788 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  43.97 
 
 		 788 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  41.55 
 
 		 776 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  37.24 
 
 		 755 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  37.24 
 
 		 731 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  37.24 
 
 		 755 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  42.43 
 
 		 755 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  38.38 
 
 		 615 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  37.52 
 
 		 622 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  35.64 
 
 		 765 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  36.07 
 
 		 318 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  35.51 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  34.29 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  27.87 
 
 		 323 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  41.72 
 
 		 581 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  30.39 
 
 		 375 aa  100  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  28.34 
 
 		 1495 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  37.8 
 
 		 284 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  30.09 
 
 		 763 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1498 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1494 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  30.43 
 
 		 379 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1459 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1498 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1439 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  27.38 
 
 		 1497 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  30.77 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1611 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1473 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  24.44 
 
 		 1473 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  28.15 
 
 		 1496 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1481 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  30.61 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  25.92 
 
 		 1481 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  25.86 
 
 		 1439 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1395 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  30.43 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  35.41 
 
 		 863 aa  67  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1393 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1395 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  32.73 
 
 		 482 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  35.44 
 
 		 1041 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  32.03 
 
 		 416 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  25.11 
 
 		 1634 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1376 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  23.85 
 
 		 1640 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  36.49 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1508 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  24.31 
 
 		 1984 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1744 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  25.64 
 
 		 1631 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.33 
 
 		 1015 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.53 
 
 		 892 aa  57.4  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.11 
 
 		 867 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  31.25 
 
 		 937 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  31.25 
 
 		 937 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  34.04 
 
 		 565 aa  53.9  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2788  leucine-rich repeat protein  30.9 
 
 		 489 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1990 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.46 
 
 		 713 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  29.29 
 
 		 761 aa  50.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  31.58 
 
 		 972 aa  50.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  23.42 
 
 		 1680 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  28.82 
 
 		 1263 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 437 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.66 
 
 		 1107 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  29.26 
 
 		 396 aa  47  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 414 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 		 447 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  33.6 
 
 		 447 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 		 421 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  32.23 
 
 		 447 aa  44.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.78 
 
 		 472 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  34.38 
 
 		 446 aa  44.3  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  26.28 
 
 		 350 aa  43.9  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  34.03 
 
 		 1344 aa  43.5  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>