116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0132 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  87.21 
 
 		 443 aa  754    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  67.6 
 
 		 547 aa  737    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  69.91 
 
 		 583 aa  754    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  69.42 
 
 		 568 aa  759    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  63.62 
 
 		 603 aa  667    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  70.55 
 
 		 575 aa  730    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  72.37 
 
 		 565 aa  782    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  100 
 
 		 574 aa  1171    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  68.5 
 
 		 545 aa  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  40.4 
 
 		 755 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  40.33 
 
 		 788 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  40.4 
 
 		 731 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  40.33 
 
 		 788 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  40.4 
 
 		 755 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  40.33 
 
 		 788 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  39.73 
 
 		 755 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  39.75 
 
 		 776 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  41.42 
 
 		 615 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  39.76 
 
 		 622 aa  355  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  37.77 
 
 		 765 aa  352  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  39.01 
 
 		 318 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  37.37 
 
 		 301 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  36.53 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  40.32 
 
 		 581 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1495 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  35.83 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  25.15 
 
 		 1494 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  25 
 
 		 1498 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  34.36 
 
 		 763 aa  84  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 		 1611 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  28.69 
 
 		 375 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  26.94 
 
 		 1473 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  26.27 
 
 		 1497 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1473 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1496 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  28.63 
 
 		 323 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  32 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1498 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  24.95 
 
 		 1481 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1459 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  25.63 
 
 		 1984 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  25.52 
 
 		 1481 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  31.98 
 
 		 379 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  35.86 
 
 		 1041 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  25.72 
 
 		 1439 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  27.42 
 
 		 1393 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1439 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  33 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  35.71 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  25.55 
 
 		 1395 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  26.4 
 
 		 1395 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  36.24 
 
 		 863 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1376 aa  63.9  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  23.76 
 
 		 1640 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  36.32 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1631 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1744 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  22.93 
 
 		 1990 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.79 
 
 		 1263 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.98 
 
 		 1015 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.49 
 
 		 867 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1508 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  30.11 
 
 		 1634 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 453 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  34.21 
 
 		 440 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1680 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 		 440 aa  53.9  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.33 
 
 		 482 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  29.02 
 
 		 447 aa  53.5  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  32.16 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  32.78 
 
 		 459 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  35.29 
 
 		 757 aa  51.2  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  25.94 
 
 		 499 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  34.17 
 
 		 450 aa  51.2  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  29.09 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  31.61 
 
 		 414 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  28.64 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  24.87 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  28.49 
 
 		 434 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  29.58 
 
 		 296 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 437 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 437 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 		 414 aa  48.5  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 437 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  32.06 
 
 		 451 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  29.06 
 
 		 1749 aa  47.4  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.16 
 
 		 892 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 471 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  31.28 
 
 		 396 aa  47  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  26.73 
 
 		 451 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  23.54 
 
 		 1690 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  32.67 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>