150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0894 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  92.29 
 
 		 765 aa  1421    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  99.45 
 
 		 731 aa  1501    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  99.87 
 
 		 755 aa  1556    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  95.1 
 
 		 755 aa  1447    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  100 
 
 		 755 aa  1558    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  40.91 
 
 		 788 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  40.78 
 
 		 788 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  40.78 
 
 		 788 aa  542  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  41.61 
 
 		 776 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  40.29 
 
 		 615 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  39.07 
 
 		 622 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  40.4 
 
 		 574 aa  402  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  37.5 
 
 		 583 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  37.44 
 
 		 545 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  42.75 
 
 		 568 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  40.38 
 
 		 565 aa  365  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  35.43 
 
 		 547 aa  348  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  44.19 
 
 		 443 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  36.77 
 
 		 575 aa  342  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  35.75 
 
 		 603 aa  326  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  38.12 
 
 		 301 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  34.11 
 
 		 318 aa  171  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  37.63 
 
 		 284 aa  156  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  35.2 
 
 		 388 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  35.63 
 
 		 1041 aa  111  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  27.56 
 
 		 375 aa  103  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  37.82 
 
 		 581 aa  101  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.45 
 
 		 1015 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  34.58 
 
 		 416 aa  94.7  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.06 
 
 		 863 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1126  secreted effector protein  42.06 
 
 		 322 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1092  secreted effector protein  42.06 
 
 		 322 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  31.34 
 
 		 435 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1494 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  28.35 
 
 		 323 aa  87.4  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  30.42 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1611 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  30.1 
 
 		 763 aa  82.4  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.11 
 
 		 1263 aa  77.8  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  32.74 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  24.44 
 
 		 1395 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1495 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.13 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  23.89 
 
 		 1393 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  24.69 
 
 		 1395 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.94 
 
 		 1107 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  30 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  30.69 
 
 		 631 aa  68.2  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  29.74 
 
 		 484 aa  67  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.08 
 
 		 892 aa  67  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  30.92 
 
 		 867 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  25.06 
 
 		 1481 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  34.43 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.09 
 
 		 1344 aa  62.4  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  28.8 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  31 
 
 		 499 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1376 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  35.26 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1481 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  23.64 
 
 		 1640 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  26.07 
 
 		 713 aa  60.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  29.75 
 
 		 761 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1459 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1497 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  25.06 
 
 		 1439 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1439 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  30.65 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1498 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  32 
 
 		 757 aa  57.4  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  30.74 
 
 		 307 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  29.76 
 
 		 937 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 		 447 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 437 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 437 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  27.75 
 
 		 296 aa  55.8  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.54 
 
 		 1679 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  29.76 
 
 		 937 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  33.56 
 
 		 459 aa  55.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  29.08 
 
 		 447 aa  54.3  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  30.26 
 
 		 421 aa  54.3  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 		 453 aa  54.3  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  28.5 
 
 		 451 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  29 
 
 		 440 aa  54.3  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.14 
 
 		 476 aa  54.3  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  27.54 
 
 		 586 aa  54.3  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  27.94 
 
 		 396 aa  53.9  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  30.65 
 
 		 1024 aa  53.5  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  29.69 
 
 		 1749 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  30.86 
 
 		 523 aa  53.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29268  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  30.14 
 
 		 647 aa  52.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106866  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  32.39 
 
 		 446 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1508 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1498 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 		 412 aa  52.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  23.19 
 
 		 886 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  31.33 
 
 		 535 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  25.97 
 
 		 479 aa  52  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  22.26 
 
 		 1634 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  25.84 
 
 		 490 aa  51.6  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>