36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90468 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_90468  predicted protein  100 
 
 		 523 aa  1046    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29610  predicted protein  29.02 
 
 		 630 aa  95.1  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.926539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  25.66 
 
 		 1266 aa  78.2  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  27.71 
 
 		 692 aa  76.6  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34969  predicted protein  29.02 
 
 		 757 aa  62.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.544485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  25.79 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03490  leucine repeat containing protein, putative  26.8 
 
 		 765 aa  60.1  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  25.61 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  26.25 
 
 		 772 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  28.02 
 
 		 877 aa  53.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  30.86 
 
 		 731 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  30.86 
 
 		 755 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  30.86 
 
 		 755 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31745  predicted protein  27.62 
 
 		 660 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.442814  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  29.94 
 
 		 375 aa  52.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29216  Leucine rich repeat protein  24.86 
 
 		 719 aa  52  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.55505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  27.91 
 
 		 776 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  28 
 
 		 755 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  28.33 
 
 		 1088 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35741  predicted protein  34.48 
 
 		 1370 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  24.7 
 
 		 765 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  26.55 
 
 		 760 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1744 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  29.15 
 
 		 384 aa  47.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28970  predicted protein  25.12 
 
 		 633 aa  47  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.366047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29047  predicted protein  25.51 
 
 		 610 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  19.13 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  26.83 
 
 		 858 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  28.46 
 
 		 935 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  26.76 
 
 		 347 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  30.61 
 
 		 587 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  23.58 
 
 		 755 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  24.73 
 
 		 766 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  28.96 
 
 		 374 aa  44.3  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  23.14 
 
 		 460 aa  44.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  25.5 
 
 		 388 aa  43.5  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>