129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3326 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  39.03 
 
 		 1439 aa  881    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  96.56 
 
 		 1395 aa  2621    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  38.76 
 
 		 1439 aa  885    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1395 aa  2790    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  76.63 
 
 		 1393 aa  2097    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  40.27 
 
 		 1459 aa  897    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  37.4 
 
 		 1376 aa  814    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  35.63 
 
 		 1744 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1495 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  30.81 
 
 		 1498 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  30.38 
 
 		 1496 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1497 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1498 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  28.73 
 
 		 1481 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1481 aa  413  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1508 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  28.36 
 
 		 1473 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1473 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  32.35 
 
 		 1611 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  27.49 
 
 		 1489 aa  294  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  28.65 
 
 		 1593 aa  294  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1631 aa  282  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1262 aa  279  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  29.84 
 
 		 1634 aa  271  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  33.12 
 
 		 1494 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1275 aa  227  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1608 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1847 aa  221  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  28.2 
 
 		 2580 aa  211  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  31.49 
 
 		 1690 aa  210  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  31.11 
 
 		 1680 aa  205  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  29.54 
 
 		 1984 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1990 aa  188  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  28.89 
 
 		 1640 aa  180  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  30.42 
 
 		 1625 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  27.51 
 
 		 971 aa  139  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  31.94 
 
 		 776 aa  90.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  29.89 
 
 		 788 aa  87  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  29.89 
 
 		 788 aa  86.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  29.29 
 
 		 788 aa  86.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  25.19 
 
 		 755 aa  80.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  27.95 
 
 		 443 aa  80.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  27.11 
 
 		 565 aa  79.7  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  24.94 
 
 		 731 aa  79.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  24.94 
 
 		 755 aa  78.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  26.44 
 
 		 583 aa  78.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  25.06 
 
 		 755 aa  77.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  25.65 
 
 		 574 aa  77.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  24.5 
 
 		 765 aa  75.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  25.77 
 
 		 615 aa  74.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.02 
 
 		 863 aa  73.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  27.23 
 
 		 603 aa  72.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  27.53 
 
 		 568 aa  72  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  34.44 
 
 		 1041 aa  71.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.43 
 
 		 1107 aa  71.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  35.75 
 
 		 354 aa  71.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  27.57 
 
 		 575 aa  70.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  31.84 
 
 		 1024 aa  69.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  26.15 
 
 		 545 aa  68.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  31.22 
 
 		 307 aa  66.6  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.12 
 
 		 1015 aa  65.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.99 
 
 		 482 aa  64.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.03 
 
 		 305 aa  63.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4855  hypothetical protein  24.66 
 
 		 934 aa  61.6  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.93 
 
 		 867 aa  61.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  26.43 
 
 		 547 aa  61.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  36.03 
 
 		 892 aa  60.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  26.51 
 
 		 565 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  32.22 
 
 		 396 aa  60.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  23.24 
 
 		 622 aa  60.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  29.19 
 
 		 467 aa  60.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.76 
 
 		 508 aa  59.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  31.52 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  28.21 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  32.28 
 
 		 490 aa  58.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 		 414 aa  57.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  31.61 
 
 		 446 aa  57.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  35.62 
 
 		 434 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  31.39 
 
 		 291 aa  57.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  34.33 
 
 		 242 aa  57.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  35.04 
 
 		 436 aa  56.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  26.55 
 
 		 2491 aa  56.2  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 436 aa  55.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.62 
 
 		 886 aa  55.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  31.22 
 
 		 451 aa  55.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  38.36 
 
 		 1263 aa  55.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  36.02 
 
 		 761 aa  54.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  29.87 
 
 		 2132 aa  53.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  34.13 
 
 		 1266 aa  53.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  30.71 
 
 		 414 aa  53.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  24.91 
 
 		 375 aa  53.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  31.55 
 
 		 416 aa  53.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.14 
 
 		 937 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  30.16 
 
 		 451 aa  53.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 		 412 aa  52.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 453 aa  52.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.14 
 
 		 937 aa  52  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4538  leucine-rich repeat protein  28.09 
 
 		 225 aa  52  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 451 aa  51.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 437 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>