212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2938 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
459 aa  937    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  57.85 
 
 
475 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  57.27 
 
 
447 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  56.82 
 
 
447 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  55.91 
 
 
447 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  53.73 
 
 
453 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  53.93 
 
 
446 aa  482  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  54.4 
 
 
451 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  53.95 
 
 
451 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  53.27 
 
 
451 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  53.05 
 
 
451 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  53.6 
 
 
441 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  50.74 
 
 
413 aa  425  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  46.94 
 
 
490 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  50.74 
 
 
412 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  50.25 
 
 
414 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  51 
 
 
421 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  48.28 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  49.5 
 
 
414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  49.63 
 
 
436 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  46.86 
 
 
445 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  46.36 
 
 
445 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  46.74 
 
 
437 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  46.74 
 
 
437 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  45.8 
 
 
499 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  44.84 
 
 
440 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  47.51 
 
 
460 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  46.97 
 
 
437 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
437 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  46.71 
 
 
441 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  48.77 
 
 
471 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  43.62 
 
 
439 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  49.14 
 
 
469 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  44.2 
 
 
436 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  44.15 
 
 
440 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  45.5 
 
 
438 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  42.53 
 
 
434 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  41.11 
 
 
464 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  42.89 
 
 
446 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  43.63 
 
 
450 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  40.22 
 
 
444 aa  322  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  40.14 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  39.68 
 
 
444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  40.29 
 
 
439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  40.4 
 
 
437 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  34.47 
 
 
484 aa  249  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  34.88 
 
 
432 aa  213  5.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  38.18 
 
 
1041 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.96 
 
 
1015 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  32.84 
 
 
416 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  37.79 
 
 
354 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  35.52 
 
 
937 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  35.52 
 
 
937 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  29.83 
 
 
482 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  36.52 
 
 
892 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.36 
 
 
1107 aa  84  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  34.34 
 
 
1263 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  38.22 
 
 
508 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  32.97 
 
 
307 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  29.57 
 
 
863 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.97 
 
 
867 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.79 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.69 
 
 
757 aa  73.6  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  35.59 
 
 
761 aa  73.6  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.44 
 
 
886 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  29.23 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  31.71 
 
 
713 aa  70.1  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.86 
 
 
472 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31.85 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  31.22 
 
 
1749 aa  66.6  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.47 
 
 
476 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  36.63 
 
 
675 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  33.61 
 
 
791 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  27.36 
 
 
925 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  29.94 
 
 
467 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  31.93 
 
 
559 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50489  predicted protein  28.57 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  33.87 
 
 
1611 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.6 
 
 
1344 aa  56.6  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.63 
 
 
1024 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  33.56 
 
 
755 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  33.56 
 
 
755 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04290  protein kinase, putative  28.12 
 
 
573 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0054946  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  30.41 
 
 
755 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  33.56 
 
 
731 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  28.57 
 
 
448 aa  54.3  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62257  predicted protein  43.94 
 
 
854 aa  54.3  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.374999  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20262  predicted protein  26.25 
 
 
290 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  27.57 
 
 
535 aa  54.3  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  26.61 
 
 
980 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01750  Cdc2 cyclin-dependent kinase, putative  21.03 
 
 
298 aa  53.9  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.588501  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  33.56 
 
 
765 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  30.5 
 
 
648 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03940  kinase, putative  28.4 
 
 
882 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.41 
 
 
579 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  32.78 
 
 
574 aa  52.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  30 
 
 
293 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06044  Protein kinase NPKA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0Q5]  27.04 
 
 
467 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  25.71 
 
 
802 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>