161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3560 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  100 
 
 
791 aa  1628    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3749  hypothetical protein  25.54 
 
 
552 aa  111  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0350  hypothetical protein  24.15 
 
 
371 aa  87  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1857  hypothetical protein  26.6 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2072  hypothetical protein  28.63 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000993237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2027  hypothetical protein  28.34 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2634600000000004e-53 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1806  hypothetical protein  27.94 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000261243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6141  Protein of unknown function DUF1963  26.46 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  33.09 
 
 
757 aa  78.2  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1851  hypothetical protein  27.53 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000701527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1994  hypothetical protein  27.53 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2091  hypothetical protein  28.34 
 
 
250 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3333  hypothetical protein  25.89 
 
 
250 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000356004  hitchhiker  6.310599999999999e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1822  hypothetical protein  27.94 
 
 
250 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121441  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  30.15 
 
 
863 aa  74.3  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2705  hypothetical protein  29.1 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  30.3 
 
 
925 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3819  hypothetical protein  31.72 
 
 
371 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1996  hypothetical protein  25.27 
 
 
250 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  27.52 
 
 
892 aa  68.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3637  hypothetical protein  31.08 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.181579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  35.82 
 
 
1041 aa  67.8  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0321  hypothetical protein  31.61 
 
 
382 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  35.25 
 
 
354 aa  65.1  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  29 
 
 
867 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
436 aa  64.3  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
412 aa  62.4  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
459 aa  62.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  33.94 
 
 
473 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  38.83 
 
 
1015 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  32.39 
 
 
648 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.85 
 
 
937 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  28.46 
 
 
242 aa  61.2  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
447 aa  60.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.17 
 
 
1263 aa  60.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.85 
 
 
937 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  32.79 
 
 
436 aa  60.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
447 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0556  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/msrB  25.44 
 
 
280 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.565002  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  33.56 
 
 
307 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  30.56 
 
 
447 aa  59.3  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
444 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2507  hypothetical protein  26.26 
 
 
271 aa  58.9  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000307283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2692  hypothetical protein  26.26 
 
 
271 aa  58.9  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 
453 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  30.22 
 
 
1351 aa  58.5  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  27.04 
 
 
886 aa  58.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  32.77 
 
 
434 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  33.9 
 
 
569 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  26.02 
 
 
460 aa  57.4  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  30.67 
 
 
416 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2434  hypothetical protein  26.01 
 
 
271 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0218077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 
441 aa  56.2  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  24.65 
 
 
482 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
475 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
439 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 
471 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  25.73 
 
 
1024 aa  55.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2707  hypothetical protein  25.64 
 
 
271 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000135449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.62 
 
 
1107 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  24.42 
 
 
499 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  29.13 
 
 
432 aa  55.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2468  hypothetical protein  25.64 
 
 
271 aa  54.7  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
444 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2757  hypothetical protein  25.54 
 
 
271 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00142476  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  26.37 
 
 
440 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  27.78 
 
 
446 aa  53.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  30.89 
 
 
413 aa  53.5  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  27.42 
 
 
414 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 
445 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
437 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
437 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 
432 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  31.75 
 
 
490 aa  52  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.97 
 
 
713 aa  52.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  25.18 
 
 
484 aa  52  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 
469 aa  52  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  25.95 
 
 
1088 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 
437 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  46.15 
 
 
565 aa  51.2  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.5 
 
 
476 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.98 
 
 
305 aa  50.8  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  20.66 
 
 
1344 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  24 
 
 
396 aa  50.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  30.53 
 
 
899 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  26.52 
 
 
296 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  27.66 
 
 
440 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
437 aa  50.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  36 
 
 
972 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  30.65 
 
 
1070 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  30.65 
 
 
1070 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 
421 aa  49.7  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  26.19 
 
 
760 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  26.19 
 
 
760 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
450 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1963  Protein of unknown function DUF1963  26.36 
 
 
276 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.28 
 
 
472 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  25.35 
 
 
559 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 
437 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  30.43 
 
 
247 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>