190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1973 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 421 aa  867    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  67.68 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  68.45 
 
 		 414 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  64.58 
 
 		 436 aa  562  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  63.36 
 
 		 412 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  62.78 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  56.78 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  54.91 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  54.41 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  53.9 
 
 		 447 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  54.66 
 
 		 447 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  55.16 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  53.15 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  52.64 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  52.39 
 
 		 451 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  51 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  50.74 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  52.14 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  49.88 
 
 		 475 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  47.94 
 
 		 490 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  48.11 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  47.86 
 
 		 469 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  46.58 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  47.99 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  47.75 
 
 		 440 aa  356  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  46.62 
 
 		 460 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  47.09 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  44.58 
 
 		 439 aa  353  4e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  46.85 
 
 		 437 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  46.85 
 
 		 437 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  46.85 
 
 		 437 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  47.09 
 
 		 445 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  45.94 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  46.6 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  46.49 
 
 		 446 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  45.13 
 
 		 499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  46.15 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  45.84 
 
 		 436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  45.41 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  44.2 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  44.67 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  43.54 
 
 		 464 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  41.94 
 
 		 439 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  47.14 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  41.98 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  41.98 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  37.16 
 
 		 484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  35.46 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  37.43 
 
 		 482 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  34.15 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  34.41 
 
 		 1041 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.24 
 
 		 1015 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  36.99 
 
 		 892 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  34.76 
 
 		 937 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.51 
 
 		 863 aa  86.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  34.76 
 
 		 937 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.18 
 
 		 867 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.96 
 
 		 1107 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  35.33 
 
 		 508 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  31.49 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.98 
 
 		 1263 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.23 
 
 		 713 aa  76.6  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  35.8 
 
 		 886 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  33.89 
 
 		 757 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  34.23 
 
 		 242 aa  72.8  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  34.11 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  31.14 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  35.71 
 
 		 761 aa  69.7  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  30.22 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  31.08 
 
 		 615 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  30.11 
 
 		 1344 aa  67  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.2 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1498 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.34 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1498 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  26.67 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  30.29 
 
 		 1024 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  25.13 
 
 		 925 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  31.36 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  28.99 
 
 		 980 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  32.43 
 
 		 1749 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  34.16 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  28.89 
 
 		 2324 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  29.61 
 
 		 1395 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.11 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  29.69 
 
 		 559 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  31.07 
 
 		 1281 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90135  cell division control protein  26.51 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0872901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1496 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1473 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  30.34 
 
 		 558 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1497 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  33.54 
 
 		 765 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  30.26 
 
 		 731 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  30.26 
 
 		 755 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  30.26 
 
 		 755 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  32.69 
 
 		 675 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  27.56 
 
 		 293 aa  53.9  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  30.5 
 
 		 329 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54126  conserved hypothetical protein  28.39 
 
 		 468 aa  53.5  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>