168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1369 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  100 
 
 
413 aa  849    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  56.37 
 
 
414 aa  468  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  56.35 
 
 
396 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  55.04 
 
 
412 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  53.83 
 
 
436 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  55.05 
 
 
447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  55.34 
 
 
451 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  56.78 
 
 
421 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  56.39 
 
 
451 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  53.53 
 
 
414 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  56.39 
 
 
451 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  54.39 
 
 
451 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  56.28 
 
 
447 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  55.28 
 
 
447 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  53.98 
 
 
453 aa  438  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  56.14 
 
 
446 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  50.74 
 
 
459 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  51.07 
 
 
475 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  51.49 
 
 
441 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  47.2 
 
 
434 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  47.18 
 
 
490 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  48.23 
 
 
437 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  49.75 
 
 
471 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  46.72 
 
 
440 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  48.26 
 
 
439 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  49.51 
 
 
438 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  49.14 
 
 
445 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  49.75 
 
 
469 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  48.49 
 
 
445 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  48.62 
 
 
441 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  48.25 
 
 
460 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  47.87 
 
 
437 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  47.87 
 
 
437 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  48.5 
 
 
437 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  45.04 
 
 
446 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  46.53 
 
 
440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  49.05 
 
 
499 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  45.23 
 
 
436 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  45.59 
 
 
444 aa  335  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  43.18 
 
 
432 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  43.77 
 
 
473 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  41.29 
 
 
464 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  43.52 
 
 
444 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  43.47 
 
 
437 aa  315  9e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  41.22 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  46.05 
 
 
450 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  37.53 
 
 
432 aa  236  6e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  34.23 
 
 
484 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  34.8 
 
 
416 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  38.98 
 
 
482 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.7 
 
 
863 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  35.56 
 
 
307 aa  94  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  34.34 
 
 
1041 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  40.37 
 
 
508 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.58 
 
 
1015 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  36.11 
 
 
892 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
937 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.76 
 
 
1107 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.67 
 
 
1263 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
937 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  34.27 
 
 
354 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  31.14 
 
 
296 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.67 
 
 
867 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  35.29 
 
 
761 aa  77.4  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.67 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  32.46 
 
 
713 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.74 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  35.39 
 
 
886 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.91 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  26.88 
 
 
569 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  28.27 
 
 
757 aa  70.5  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  31.72 
 
 
1749 aa  70.1  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  29.83 
 
 
242 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  31.48 
 
 
1024 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  30.15 
 
 
1393 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  31.58 
 
 
1395 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  29.35 
 
 
448 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  28.37 
 
 
980 aa  60.1  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  33.33 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  30.53 
 
 
1395 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62257  predicted protein  39.73 
 
 
854 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.374999  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  26.02 
 
 
467 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  28.95 
 
 
2324 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  29.41 
 
 
925 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  27.98 
 
 
580 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  30.81 
 
 
230 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  26.55 
 
 
1344 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  29.79 
 
 
528 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  30.38 
 
 
478 aa  54.3  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  25.81 
 
 
263 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  32.88 
 
 
1494 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  30.89 
 
 
791 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  34.55 
 
 
675 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  30.17 
 
 
643 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2065  leucine-rich repeat protein  38.67 
 
 
108 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  27.12 
 
 
772 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  29.49 
 
 
1498 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  31.41 
 
 
648 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  26.63 
 
 
1088 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01620  leucin rich protein  25.97 
 
 
656 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>