240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3413 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  80.98 
 
 		 447 aa  744    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  72.93 
 
 		 451 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 447 aa  909    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  96.2 
 
 		 447 aa  876    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  89.98 
 
 		 453 aa  805    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  73.09 
 
 		 451 aa  663    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  73.77 
 
 		 451 aa  671    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  73.99 
 
 		 451 aa  671    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  73.74 
 
 		 446 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  60.86 
 
 		 441 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  57.58 
 
 		 475 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  56.82 
 
 		 459 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  55.28 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  52.76 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  51.45 
 
 		 490 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  53.72 
 
 		 414 aa  435  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  53.02 
 
 		 396 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  53.09 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  53.9 
 
 		 421 aa  428  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  52.14 
 
 		 414 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  49.89 
 
 		 440 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  51.24 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  49.77 
 
 		 436 aa  408  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  51.13 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  50.11 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  49.89 
 
 		 437 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  48.87 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  49.89 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  48.64 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  48.87 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  49.1 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  48.99 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  48.54 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  48.54 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  48.3 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  45.8 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  47.97 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  47.87 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  48.64 
 
 		 450 aa  350  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  44.28 
 
 		 464 aa  349  7e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  44.78 
 
 		 432 aa  338  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  45.74 
 
 		 444 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  44.32 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  43.85 
 
 		 439 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  44.09 
 
 		 473 aa  326  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  45.23 
 
 		 437 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  38.16 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  34.99 
 
 		 432 aa  213  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  40.37 
 
 		 1041 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  41.76 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  36.81 
 
 		 482 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  37.04 
 
 		 1015 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.34 
 
 		 863 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  34.83 
 
 		 867 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  36.97 
 
 		 508 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.74 
 
 		 1107 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  36.31 
 
 		 892 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 937 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  34.76 
 
 		 354 aa  87  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 937 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  32.58 
 
 		 1263 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  31.46 
 
 		 757 aa  84.7  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  34.22 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  30.55 
 
 		 761 aa  84  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  35.15 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.96 
 
 		 713 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  28.49 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.25 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  35.19 
 
 		 886 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  35.38 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  25.91 
 
 		 1749 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.68 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.34 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  32.37 
 
 		 615 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  29.85 
 
 		 755 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  27.13 
 
 		 569 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  31.34 
 
 		 791 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  32.58 
 
 		 574 aa  60.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  34.07 
 
 		 648 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  29.53 
 
 		 1344 aa  59.3  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  37.59 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  30.63 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  31.09 
 
 		 980 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  34.58 
 
 		 675 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  30 
 
 		 1024 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  23.37 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  33.11 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  29.45 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  29.91 
 
 		 601 aa  57.4  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  33.09 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1498 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  32.04 
 
 		 547 aa  57  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38832  predicted protein  24.58 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00223865  hitchhiker  0.00603177 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  30.1 
 
 		 755 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  30.1 
 
 		 731 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  30.1 
 
 		 755 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  30.28 
 
 		 318 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10647  predicted protein  43.86 
 
 		 75 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642206  normal  0.0385264 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01750  Cdc2 cyclin-dependent kinase, putative  23.45 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.588501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>