137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2369 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  38.83 
 
 		 1439 aa  882    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 1395 aa  2788    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  38.55 
 
 		 1439 aa  886    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  96.56 
 
 		 1395 aa  2597    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  77.06 
 
 		 1393 aa  2100    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  40.2 
 
 		 1459 aa  902    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  38.21 
 
 		 1376 aa  858    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1744 aa  683    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  32.86 
 
 		 1495 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1498 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1496 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  30.11 
 
 		 1497 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1498 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  28.45 
 
 		 1481 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  28.63 
 
 		 1481 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1508 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1473 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1473 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  31.96 
 
 		 1611 aa  330  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3108  leucine-rich repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1593 aa  289  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3302  leucine-rich repeat-containing protein  27.9 
 
 		 1489 aa  287  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  30.84 
 
 		 1631 aa  285  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1262 aa  271  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  29.84 
 
 		 1634 aa  270  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  33.97 
 
 		 1494 aa  256  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0436  leucine-rich repeat-containing protein  25.74 
 
 		 1847 aa  224  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2340  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1608 aa  221  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2494  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1275 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.258139  normal  0.329093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4286  leucine-rich repeat-containing protein  28.2 
 
 		 2580 aa  214  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  29.63 
 
 		 1984 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2566  leucine-rich repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1690 aa  197  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  26.68 
 
 		 1990 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  30.15 
 
 		 1680 aa  192  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  29.38 
 
 		 1640 aa  188  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2968  leucine-rich repeat-containing protein  30.17 
 
 		 1625 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.813294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4562  hypothetical protein  27.51 
 
 		 971 aa  138  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  31.79 
 
 		 776 aa  92  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  29.89 
 
 		 788 aa  87.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  30.47 
 
 		 788 aa  87.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  29.29 
 
 		 788 aa  87  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  24.44 
 
 		 755 aa  82  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  24.2 
 
 		 755 aa  80.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  24.2 
 
 		 731 aa  80.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  25.98 
 
 		 615 aa  80.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  27.99 
 
 		 443 aa  78.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  25.41 
 
 		 583 aa  77.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  24.07 
 
 		 755 aa  77  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  25.55 
 
 		 574 aa  75.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.09 
 
 		 863 aa  75.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  23.21 
 
 		 765 aa  73.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  32.34 
 
 		 1024 aa  72.8  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  26.77 
 
 		 603 aa  73.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  33.92 
 
 		 1041 aa  72.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  26.94 
 
 		 565 aa  72.4  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  36.27 
 
 		 354 aa  72  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.73 
 
 		 1107 aa  71.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.07 
 
 		 1015 aa  70.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  23.86 
 
 		 622 aa  69.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  27.08 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  30.16 
 
 		 307 aa  67.4  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  26.13 
 
 		 575 aa  67.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  25.95 
 
 		 545 aa  67  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.99 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.15 
 
 		 867 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  40 
 
 		 761 aa  63.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  31.58 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  32.22 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0348  hypothetical protein  22.05 
 
 		 928 aa  62  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  35.29 
 
 		 892 aa  62  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  25.9 
 
 		 565 aa  61.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0373  hypothetical protein  22.12 
 
 		 928 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.16 
 
 		 305 aa  60.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  29.19 
 
 		 467 aa  60.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  26.18 
 
 		 547 aa  60.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.14 
 
 		 1263 aa  60.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  35.93 
 
 		 1266 aa  59.3  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  33.14 
 
 		 508 aa  59.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  26.56 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  29.69 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  35.62 
 
 		 434 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  32.32 
 
 		 414 aa  58.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.62 
 
 		 886 aa  57  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  31.65 
 
 		 490 aa  57.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  31.39 
 
 		 291 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  34.33 
 
 		 242 aa  56.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  26.92 
 
 		 448 aa  56.2  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 436 aa  55.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 		 421 aa  55.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  31.5 
 
 		 412 aa  55.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  25.84 
 
 		 2491 aa  54.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  30.65 
 
 		 451 aa  54.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  29.87 
 
 		 2132 aa  53.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  33.33 
 
 		 416 aa  54.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4855  hypothetical protein  24.07 
 
 		 934 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 		 437 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  30.66 
 
 		 414 aa  52.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 451 aa  52.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  30.65 
 
 		 446 aa  52.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  30.6 
 
 		 439 aa  52.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>