190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3247 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 
2324 aa  4648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1865  leucine-rich repeat-containing protein  38.67 
 
 
237 aa  116  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.956378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  26.62 
 
 
1263 aa  105  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  26.13 
 
 
713 aa  98.6  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  34.3 
 
 
2491 aa  98.6  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  24.79 
 
 
508 aa  94  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  30.71 
 
 
1290 aa  88.2  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44315  predicted protein  39.2 
 
 
348 aa  82  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  25 
 
 
482 aa  82  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  25.21 
 
 
1024 aa  81.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.85 
 
 
892 aa  81.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  22.56 
 
 
1012 aa  79.7  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  24.59 
 
 
867 aa  77  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  27.03 
 
 
601 aa  77  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  25.34 
 
 
416 aa  76.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  24.13 
 
 
640 aa  76.6  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.89 
 
 
1107 aa  75.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  23.69 
 
 
1041 aa  74.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  31.28 
 
 
863 aa  74.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  25.52 
 
 
543 aa  73.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  42.35 
 
 
716 aa  73.9  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  35.17 
 
 
1000 aa  72.8  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  31.67 
 
 
230 aa  72.4  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  32.62 
 
 
685 aa  71.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  34.02 
 
 
354 aa  70.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1196  predicted protein  40.83 
 
 
304 aa  70.9  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  32.72 
 
 
242 aa  69.7  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  34.51 
 
 
249 aa  69.7  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46212  predicted protein  32.09 
 
 
768 aa  69.3  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.36 
 
 
886 aa  68.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  23.94 
 
 
283 aa  68.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.67 
 
 
472 aa  68.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  37.04 
 
 
1749 aa  67.8  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  38.05 
 
 
447 aa  67.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  37.61 
 
 
448 aa  67.4  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39117  predicted protein  32.86 
 
 
587 aa  67  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294419  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44441  predicted protein  29.27 
 
 
4500 aa  66.6  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.06 
 
 
476 aa  66.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  35.38 
 
 
526 aa  65.9  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  27.32 
 
 
1017 aa  65.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  40 
 
 
679 aa  64.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  25.2 
 
 
1112 aa  63.9  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  21.79 
 
 
972 aa  63.9  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  24.71 
 
 
1070 aa  63.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  24.71 
 
 
1070 aa  63.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  31.69 
 
 
1015 aa  63.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  43.69 
 
 
334 aa  63.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  31.61 
 
 
291 aa  63.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  29.3 
 
 
692 aa  63.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  33.16 
 
 
937 aa  63.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4344  predicted protein  37.37 
 
 
169 aa  62  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  27.59 
 
 
247 aa  62.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.15 
 
 
757 aa  62.4  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  36.97 
 
 
899 aa  62.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
436 aa  62.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_6311  predicted protein  36.73 
 
 
127 aa  62  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49671  predicted protein  34.04 
 
 
454 aa  61.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.245553  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  28.85 
 
 
937 aa  61.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  28.57 
 
 
307 aa  61.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  33.07 
 
 
467 aa  60.5  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  29.79 
 
 
648 aa  59.7  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  35.16 
 
 
454 aa  59.7  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  31.21 
 
 
436 aa  58.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  42.25 
 
 
516 aa  58.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  29.61 
 
 
204 aa  57.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86229  predicted protein  35.96 
 
 
497 aa  58.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  30.46 
 
 
1744 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01870  conserved hypothetical protein  26.36 
 
 
840 aa  57.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  27.55 
 
 
263 aa  57.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11423  predicted protein  36.26 
 
 
168 aa  57.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  34.03 
 
 
761 aa  57.4  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  28.95 
 
 
413 aa  57.4  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  32.68 
 
 
414 aa  57.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33901  predicted protein  29.71 
 
 
596 aa  57.4  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  29.82 
 
 
760 aa  57  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1379  predicted protein  38.3 
 
 
350 aa  57  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.815814  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  41.54 
 
 
152 aa  57  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 
421 aa  57  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
439 aa  57.4  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  33.67 
 
 
304 aa  57  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  26.62 
 
 
296 aa  56.6  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38108  predicted protein  30.83 
 
 
461 aa  57  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  24.17 
 
 
993 aa  56.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  27.66 
 
 
1162 aa  56.2  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 
412 aa  56.2  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46795  predicted protein  31.03 
 
 
394 aa  55.8  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0217893  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  22.51 
 
 
1344 aa  55.5  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  34.52 
 
 
293 aa  55.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  35.23 
 
 
545 aa  55.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  33.04 
 
 
225 aa  55.5  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  28.36 
 
 
451 aa  55.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  26.21 
 
 
760 aa  55.5  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15749  predicted protein  44.3 
 
 
81 aa  55.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00765977  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  35.87 
 
 
744 aa  54.7  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4339  predicted protein  29.8 
 
 
222 aa  55.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00625498  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_10647  predicted protein  44.62 
 
 
75 aa  54.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0642206  normal  0.0385264 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  30.09 
 
 
293 aa  54.7  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  28.57 
 
 
446 aa  54.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49666  predicted protein  27.27 
 
 
540 aa  54.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  27.91 
 
 
396 aa  55.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>