159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0085 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 464 aa  916    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  58.61 
 
 		 437 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  57.52 
 
 		 445 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  55.82 
 
 		 440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  56.21 
 
 		 445 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  57.05 
 
 		 437 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  57.05 
 
 		 437 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  57.48 
 
 		 441 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  57.73 
 
 		 460 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  56.18 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  59.38 
 
 		 471 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  56.25 
 
 		 436 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  55.43 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  59.72 
 
 		 469 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  56.58 
 
 		 499 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  56.14 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  54.41 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  56.46 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  53.7 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  54.77 
 
 		 439 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  56.64 
 
 		 450 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  52.93 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  50.87 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  51.19 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  50.98 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  45.77 
 
 		 451 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  45.55 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  44.61 
 
 		 447 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  45.55 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  45.04 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  44.9 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  42.28 
 
 		 475 aa  362  9e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  42.67 
 
 		 439 aa  360  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  41.11 
 
 		 459 aa  361  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  44.3 
 
 		 447 aa  359  7e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  44.28 
 
 		 447 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  42.67 
 
 		 453 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  42.25 
 
 		 490 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  43.94 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  42.46 
 
 		 441 aa  342  7e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  43.91 
 
 		 414 aa  339  7e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  42.5 
 
 		 412 aa  329  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  42.29 
 
 		 414 aa  327  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  41.29 
 
 		 413 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  43.54 
 
 		 421 aa  324  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  40 
 
 		 396 aa  319  5e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  40.89 
 
 		 484 aa  277  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  36.36 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  35.32 
 
 		 1263 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  38.76 
 
 		 508 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  35.2 
 
 		 482 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.2 
 
 		 1015 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  31.8 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  36.57 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.37 
 
 		 892 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.04 
 
 		 1041 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  30.77 
 
 		 937 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  35.2 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  36.26 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  30.77 
 
 		 937 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  35.19 
 
 		 761 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.89 
 
 		 863 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.07 
 
 		 1107 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  32.02 
 
 		 867 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.83 
 
 		 886 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  34.46 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  29.95 
 
 		 1024 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  22.03 
 
 		 757 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.6 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  29.67 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.17 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.78 
 
 		 1344 aa  57.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  28.38 
 
 		 384 aa  57  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.37 
 
 		 1749 aa  56.6  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  32.06 
 
 		 760 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  28.39 
 
 		 760 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  32.06 
 
 		 766 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  33.11 
 
 		 1266 aa  55.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  30.89 
 
 		 528 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.8 
 
 		 305 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  35 
 
 		 788 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  32.79 
 
 		 755 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  35 
 
 		 788 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1744 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  29.33 
 
 		 531 aa  54.7  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  27.75 
 
 		 296 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  31.17 
 
 		 615 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  29.05 
 
 		 713 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  38.64 
 
 		 2132 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  33.72 
 
 		 980 aa  53.9  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  28.72 
 
 		 565 aa  53.9  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  35 
 
 		 788 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  26.92 
 
 		 467 aa  53.1  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  25.52 
 
 		 263 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2065  leucine-rich repeat protein  40.79 
 
 		 108 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  24.47 
 
 		 925 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  30.07 
 
 		 1112 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  27.62 
 
 		 574 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  34.75 
 
 		 230 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  31.3 
 
 		 779 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>