122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2065 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2065  leucine-rich repeat protein  100 
 
 
108 aa  210  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  50.93 
 
 
482 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  49.45 
 
 
1041 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  50 
 
 
508 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03790  conserved hypothetical protein  46.67 
 
 
744 aa  72  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  48.24 
 
 
354 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  47.73 
 
 
1263 aa  67.8  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  45.33 
 
 
675 aa  65.5  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  44.09 
 
 
892 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  46.15 
 
 
416 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  53.85 
 
 
291 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  52.86 
 
 
867 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  48 
 
 
886 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  43.9 
 
 
445 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  38.32 
 
 
1015 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  45.33 
 
 
863 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.54 
 
 
1107 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  43.96 
 
 
937 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  43.96 
 
 
937 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  43.84 
 
 
296 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  41.46 
 
 
445 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  40.48 
 
 
451 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  40.48 
 
 
451 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  42.86 
 
 
467 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  38.37 
 
 
437 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  38.37 
 
 
437 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  39.29 
 
 
446 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  38.37 
 
 
437 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  39.29 
 
 
451 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  43.75 
 
 
713 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  39.29 
 
 
451 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  36.9 
 
 
447 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
453 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  34.07 
 
 
437 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  40.26 
 
 
1024 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  48.57 
 
 
307 aa  53.5  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  35.53 
 
 
490 aa  52.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 
447 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 
475 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  43.84 
 
 
448 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  37.84 
 
 
305 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 
440 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  42.53 
 
 
757 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
439 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  38.67 
 
 
413 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 
447 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  42.67 
 
 
1749 aa  51.6  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  35.62 
 
 
569 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  47.76 
 
 
2491 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 
444 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  33.03 
 
 
648 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  46.05 
 
 
761 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  36.9 
 
 
471 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  37.33 
 
 
441 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  36 
 
 
460 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  34.21 
 
 
438 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 
437 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  31.51 
 
 
1088 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  37.33 
 
 
469 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  37.14 
 
 
558 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 
439 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  30.3 
 
 
432 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  36.76 
 
 
476 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  43.84 
 
 
443 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  36 
 
 
396 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 
414 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  34.72 
 
 
472 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  40.28 
 
 
580 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  35.79 
 
 
1000 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  39.53 
 
 
230 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  37.31 
 
 
980 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4538  leucine-rich repeat protein  41.67 
 
 
225 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0946  hypothetical protein  39.68 
 
 
333 aa  47  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000225711 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  41.89 
 
 
247 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 
444 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02720  expressed protein  33.7 
 
 
553 aa  47  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  37.8 
 
 
242 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  36 
 
 
459 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
436 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  37.18 
 
 
434 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  43.08 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  34.94 
 
 
293 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 
473 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  38.67 
 
 
1017 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
450 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  40.26 
 
 
559 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 
436 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  36 
 
 
446 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  40.48 
 
 
249 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  36 
 
 
972 aa  43.9  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  41.25 
 
 
565 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  44.78 
 
 
601 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 
2324 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
412 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  34.21 
 
 
2132 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.27 
 
 
1344 aa  43.9  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  33.33 
 
 
414 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  38.46 
 
 
1012 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  31.03 
 
 
1281 aa  43.5  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  36 
 
 
1744 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>