251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0557 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  86.97 
 
 
445 aa  776    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  100 
 
 
445 aa  890    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  68.86 
 
 
471 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  67.5 
 
 
437 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  67.73 
 
 
441 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  67.27 
 
 
437 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  67.27 
 
 
437 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  67.72 
 
 
469 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  67.43 
 
 
460 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  64.93 
 
 
440 aa  552  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  62.84 
 
 
436 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  60.23 
 
 
437 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  60.46 
 
 
499 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  58.7 
 
 
434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  58.78 
 
 
438 aa  468  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  58.58 
 
 
446 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  57.52 
 
 
464 aa  465  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  58.31 
 
 
440 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  52.33 
 
 
451 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  52.11 
 
 
451 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  50.91 
 
 
439 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  51.21 
 
 
451 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  51 
 
 
451 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  51.14 
 
 
446 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  52.36 
 
 
447 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  50 
 
 
447 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  51.24 
 
 
447 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  51.45 
 
 
453 aa  415  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  57.14 
 
 
450 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  48.92 
 
 
475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  46.86 
 
 
459 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  45.99 
 
 
490 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  47.43 
 
 
441 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  55.47 
 
 
439 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  53.02 
 
 
444 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  48.31 
 
 
412 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  48.62 
 
 
414 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  49.32 
 
 
432 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  51.5 
 
 
444 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  52.19 
 
 
437 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  48.49 
 
 
413 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  51.27 
 
 
473 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  46.73 
 
 
414 aa  355  6.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  46.06 
 
 
436 aa  355  8.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  47.09 
 
 
421 aa  354  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  43.97 
 
 
396 aa  348  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  41.98 
 
 
484 aa  296  5e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  39.67 
 
 
432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  34.65 
 
 
307 aa  94  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  36.82 
 
 
416 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  31.03 
 
 
1041 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  34.38 
 
 
508 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.66 
 
 
1263 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.51 
 
 
1015 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  35.4 
 
 
482 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.46 
 
 
1107 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.32 
 
 
937 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.32 
 
 
937 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.7 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  30.69 
 
 
892 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  31.65 
 
 
761 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  33.11 
 
 
867 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  27.37 
 
 
863 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  28.99 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  32.4 
 
 
472 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  27.27 
 
 
713 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  25.81 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  37.32 
 
 
648 aa  67  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.32 
 
 
757 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  33.09 
 
 
448 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.95 
 
 
305 aa  61.6  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  31.93 
 
 
886 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  32.68 
 
 
1498 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  30.23 
 
 
467 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  30.59 
 
 
291 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2065  leucine-rich repeat protein  41.46 
 
 
108 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  29.24 
 
 
1749 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  31.98 
 
 
972 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  28.93 
 
 
559 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  31.47 
 
 
1498 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  30.36 
 
 
1024 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  26.92 
 
 
1018 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  28.95 
 
 
293 aa  54.7  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  35.59 
 
 
558 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  28.19 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7508  predicted protein  39.19 
 
 
149 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  31.94 
 
 
1496 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  31.18 
 
 
1088 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.23 
 
 
476 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51279  predicted protein  27.48 
 
 
298 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04290  protein kinase, putative  25.71 
 
 
573 aa  53.9  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0054946  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.5 
 
 
503 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  31.25 
 
 
1497 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  23.08 
 
 
925 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  27.22 
 
 
623 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.32 
 
 
737 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3644  protein kinase  24.52 
 
 
426 aa  53.1  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0238226  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  29.27 
 
 
293 aa  53.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  21.94 
 
 
980 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  32.93 
 
 
334 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>